Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGH2

Samm50, Sorting and assembly machinery component 50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samm50Q8BGH2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Samm50Q8BGH2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Samm50Q8BGH2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Samm50Q8BGH2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Samm50Q8BGH2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Samm50Q8BGH2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Samm50Q8BGH2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Samm50Q8BGH2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Samm50Q8BGH2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Samm50Q8BGH2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Samm50Q8BGH2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Samm50Q8BGH2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Samm50Q8BGH2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Samm50Q8BGH2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Samm50Q8BGH2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Samm50Q8BGH2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Samm50Q8BGH2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Samm50Q8BGH2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Samm50Q8BGH2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Samm50Q8BGH2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Samm50Q8BGH2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Samm50Q8BGH2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Samm50Q8BGH2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Samm50Q8BGH2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Samm50Q8BGH2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Samm50Q8BGH2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Samm50Q8BGH2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Samm50Q8BGH2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Samm50Q8BGH2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Samm50Q8BGH2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Samm50Q8BGH2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Samm50Q8BGH2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Samm50Q8BGH2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Samm50Q8BGH2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Samm50Q8BGH2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Samm50Q8BGH2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Samm50Q8BGH2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Samm50Q8BGH2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Samm50Q8BGH2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Samm50Q8BGH2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Samm50Q8BGH2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Samm50Q8BGH2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Samm50Q8BGH2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Samm50Q8BGH2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Samm50Q8BGH2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Samm50Q8BGH2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Samm50Q8BGH2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Samm50Q8BGH2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Samm50Q8BGH2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Samm50Q8BGH2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Samm50Q8BGH2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Samm50Q8BGH2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Samm50Q8BGH2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Samm50Q8BGH2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Samm50Q8BGH2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Samm50Q8BGH2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Samm50Q8BGH2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Samm50Q8BGH2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Samm50Q8BGH2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Samm50Q8BGH2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Samm50Q8BGH2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Samm50Q8BGH2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Samm50Q8BGH2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Samm50Q8BGH2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Samm50Q8BGH2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Samm50Q8BGH2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Samm50Q8BGH2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Samm50Q8BGH2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Samm50Q8BGH2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Samm50Q8BGH2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Samm50Q8BGH2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Samm50Q8BGH2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Samm50Q8BGH2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Samm50Q8BGH2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Samm50Q8BGH2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Samm50Q8BGH2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Samm50Q8BGH2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Samm50Q8BGH2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Samm50Q8BGH2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Samm50Q8BGH2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Samm50Q8BGH2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Samm50Q8BGH2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Samm50Q8BGH2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Samm50Q8BGH2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Samm50Q8BGH2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Samm50Q8BGH2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Samm50Q8BGH2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Samm50Q8BGH2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Samm50Q8BGH2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Samm50Q8BGH2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Samm50Q8BGH2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Samm50Q8BGH2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Samm50Q8BGH2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Samm50Q8BGH2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Samm50Q8BGH2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Samm50Q8BGH2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Samm50Q8BGH2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Samm50Q8BGH2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Samm50Q8BGH2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Samm50Q8BGH2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms