Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg4bQ8BGE6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg4bQ8BGE6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg4bQ8BGE6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg4bQ8BGE6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg4bQ8BGE6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg4bQ8BGE6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg4bQ8BGE6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg4bQ8BGE6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg4bQ8BGE6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg4bQ8BGE6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg4bQ8BGE6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg4bQ8BGE6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg4bQ8BGE6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg4bQ8BGE6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg4bQ8BGE6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg4bQ8BGE6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg4bQ8BGE6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg4bQ8BGE6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg4bQ8BGE6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg4bQ8BGE6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg4bQ8BGE6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg4bQ8BGE6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg4bQ8BGE6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms