Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG73

Sh3bgrl2, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms