Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG54

Sptlc3, Serine palmitoyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptlc3Q8BG54 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sptlc3Q8BG54 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sptlc3Q8BG54 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sptlc3Q8BG54 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sptlc3Q8BG54 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sptlc3Q8BG54 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sptlc3Q8BG54 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sptlc3Q8BG54 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sptlc3Q8BG54 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sptlc3Q8BG54 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sptlc3Q8BG54 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sptlc3Q8BG54 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sptlc3Q8BG54 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sptlc3Q8BG54 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sptlc3Q8BG54 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sptlc3Q8BG54 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sptlc3Q8BG54 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sptlc3Q8BG54 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sptlc3Q8BG54 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sptlc3Q8BG54 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sptlc3Q8BG54 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sptlc3Q8BG54 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sptlc3Q8BG54 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Sptlc3Q8BG54 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sptlc3Q8BG54 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sptlc3Q8BG54 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sptlc3Q8BG54 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sptlc3Q8BG54 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sptlc3Q8BG54 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sptlc3Q8BG54 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Sptlc3Q8BG54 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sptlc3Q8BG54 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sptlc3Q8BG54 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sptlc3Q8BG54 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sptlc3Q8BG54 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sptlc3Q8BG54 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sptlc3Q8BG54 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sptlc3Q8BG54 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sptlc3Q8BG54 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sptlc3Q8BG54 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Sptlc3Q8BG54 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sptlc3Q8BG54 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sptlc3Q8BG54 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sptlc3Q8BG54 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sptlc3Q8BG54 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sptlc3Q8BG54 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sptlc3Q8BG54 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Sptlc3Q8BG54 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Sptlc3Q8BG54 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sptlc3Q8BG54 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sptlc3Q8BG54 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sptlc3Q8BG54 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sptlc3Q8BG54 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sptlc3Q8BG54 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sptlc3Q8BG54 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sptlc3Q8BG54 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Sptlc3Q8BG54 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sptlc3Q8BG54 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sptlc3Q8BG54 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sptlc3Q8BG54 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Sptlc3Q8BG54 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sptlc3Q8BG54 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sptlc3Q8BG54 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sptlc3Q8BG54 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sptlc3Q8BG54 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sptlc3Q8BG54 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sptlc3Q8BG54 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sptlc3Q8BG54 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sptlc3Q8BG54 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sptlc3Q8BG54 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Sptlc3Q8BG54 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sptlc3Q8BG54 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sptlc3Q8BG54 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sptlc3Q8BG54 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sptlc3Q8BG54 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sptlc3Q8BG54 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sptlc3Q8BG54 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Sptlc3Q8BG54 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sptlc3Q8BG54 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sptlc3Q8BG54 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sptlc3Q8BG54 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sptlc3Q8BG54 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sptlc3Q8BG54 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sptlc3Q8BG54 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sptlc3Q8BG54 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sptlc3Q8BG54 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sptlc3Q8BG54 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sptlc3Q8BG54 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Sptlc3Q8BG54 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sptlc3Q8BG54 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sptlc3Q8BG54 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sptlc3Q8BG54 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sptlc3Q8BG54 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sptlc3Q8BG54 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sptlc3Q8BG54 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sptlc3Q8BG54 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sptlc3Q8BG54 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sptlc3Q8BG54 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sptlc3Q8BG54 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sptlc3Q8BG54 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms