Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M10.4Q85ZW8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M10.4Q85ZW8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M10.4Q85ZW8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M10.4Q85ZW8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms