Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW6

H2-M10.3, Histocompatibility 2, M region locus 10.3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.3Q85ZW6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M10.3Q85ZW6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2-M10.3Q85ZW6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-M10.3Q85ZW6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-M10.3Q85ZW6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-M10.3Q85ZW6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-M10.3Q85ZW6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-M10.3Q85ZW6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-M10.3Q85ZW6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-M10.3Q85ZW6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-M10.3Q85ZW6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-M10.3Q85ZW6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-M10.3Q85ZW6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-M10.3Q85ZW6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-M10.3Q85ZW6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-M10.3Q85ZW6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-M10.3Q85ZW6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-M10.3Q85ZW6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-M10.3Q85ZW6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-M10.3Q85ZW6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-M10.3Q85ZW6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-M10.3Q85ZW6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-M10.3Q85ZW6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-M10.3Q85ZW6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-M10.3Q85ZW6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-M10.3Q85ZW6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-M10.3Q85ZW6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-M10.3Q85ZW6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-M10.3Q85ZW6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-M10.3Q85ZW6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-M10.3Q85ZW6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-M10.3Q85ZW6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-M10.3Q85ZW6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms