Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NfascQ810U3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NfascQ810U3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NfascQ810U3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NfascQ810U3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NfascQ810U3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NfascQ810U3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NfascQ810U3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NfascQ810U3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NfascQ810U3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NfascQ810U3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NfascQ810U3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NfascQ810U3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NfascQ810U3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NfascQ810U3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NfascQ810U3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NfascQ810U3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NfascQ810U3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NfascQ810U3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NfascQ810U3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NfascQ810U3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NfascQ810U3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NfascQ810U3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NfascQ810U3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NfascQ810U3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NfascQ810U3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NfascQ810U3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NfascQ810U3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NfascQ810U3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NfascQ810U3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NfascQ810U3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NfascQ810U3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NfascQ810U3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NfascQ810U3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NfascQ810U3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NfascQ810U3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NfascQ810U3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NfascQ810U3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NfascQ810U3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NfascQ810U3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NfascQ810U3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NfascQ810U3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NfascQ810U3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NfascQ810U3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NfascQ810U3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NfascQ810U3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NfascQ810U3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NfascQ810U3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NfascQ810U3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NfascQ810U3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NfascQ810U3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NfascQ810U3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NfascQ810U3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NfascQ810U3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NfascQ810U3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NfascQ810U3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NfascQ810U3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NfascQ810U3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NfascQ810U3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NfascQ810U3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NfascQ810U3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NfascQ810U3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NfascQ810U3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NfascQ810U3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NfascQ810U3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NfascQ810U3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NfascQ810U3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NfascQ810U3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NfascQ810U3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NfascQ810U3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NfascQ810U3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NfascQ810U3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NfascQ810U3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NfascQ810U3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NfascQ810U3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NfascQ810U3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NfascQ810U3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NfascQ810U3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NfascQ810U3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NfascQ810U3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NfascQ810U3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NfascQ810U3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NfascQ810U3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NfascQ810U3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NfascQ810U3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NfascQ810U3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NfascQ810U3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NfascQ810U3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NfascQ810U3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NfascQ810U3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NfascQ810U3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NfascQ810U3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NfascQ810U3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NfascQ810U3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NfascQ810U3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NfascQ810U3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NfascQ810U3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NfascQ810U3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NfascQ810U3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NfascQ810U3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms