Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc172Q810N9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc172Q810N9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc172Q810N9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc172Q810N9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc172Q810N9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc172Q810N9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc172Q810N9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc172Q810N9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc172Q810N9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc172Q810N9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc172Q810N9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc172Q810N9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc172Q810N9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc172Q810N9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc172Q810N9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc172Q810N9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc172Q810N9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc172Q810N9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc172Q810N9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc172Q810N9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc172Q810N9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc172Q810N9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc172Q810N9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc172Q810N9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc172Q810N9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc172Q810N9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc172Q810N9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc172Q810N9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc172Q810N9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc172Q810N9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc172Q810N9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc172Q810N9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc172Q810N9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc172Q810N9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc172Q810N9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc172Q810N9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc172Q810N9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc172Q810N9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc172Q810N9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc172Q810N9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc172Q810N9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc172Q810N9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc172Q810N9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc172Q810N9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc172Q810N9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc172Q810N9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc172Q810N9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc172Q810N9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc172Q810N9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc172Q810N9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc172Q810N9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc172Q810N9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc172Q810N9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc172Q810N9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc172Q810N9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc172Q810N9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc172Q810N9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc172Q810N9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc172Q810N9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc172Q810N9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc172Q810N9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc172Q810N9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc172Q810N9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc172Q810N9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc172Q810N9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc172Q810N9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc172Q810N9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc172Q810N9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc172Q810N9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc172Q810N9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc172Q810N9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc172Q810N9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc172Q810N9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc172Q810N9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc172Q810N9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc172Q810N9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc172Q810N9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc172Q810N9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc172Q810N9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc172Q810N9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc172Q810N9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc172Q810N9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc172Q810N9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc172Q810N9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc172Q810N9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc172Q810N9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc172Q810N9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc172Q810N9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc172Q810N9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc172Q810N9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc172Q810N9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc172Q810N9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc172Q810N9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc172Q810N9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc172Q810N9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc172Q810N9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc172Q810N9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc172Q810N9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc172Q810N9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms