Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z71

Tnn, Tenascin-N, mousemouse

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnnQ80Z71 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TnnQ80Z71 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TnnQ80Z71 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TnnQ80Z71 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TnnQ80Z71 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TnnQ80Z71 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TnnQ80Z71 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TnnQ80Z71 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TnnQ80Z71 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
TnnQ80Z71 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TnnQ80Z71 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TnnQ80Z71 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TnnQ80Z71 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TnnQ80Z71 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TnnQ80Z71 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TnnQ80Z71 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TnnQ80Z71 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TnnQ80Z71 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TnnQ80Z71 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TnnQ80Z71 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TnnQ80Z71 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TnnQ80Z71 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TnnQ80Z71 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
TnnQ80Z71 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TnnQ80Z71 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TnnQ80Z71 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TnnQ80Z71 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TnnQ80Z71 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
TnnQ80Z71 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TnnQ80Z71 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
TnnQ80Z71 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TnnQ80Z71 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TnnQ80Z71 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TnnQ80Z71 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
TnnQ80Z71 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TnnQ80Z71 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TnnQ80Z71 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
TnnQ80Z71 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TnnQ80Z71 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TnnQ80Z71 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TnnQ80Z71 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TnnQ80Z71 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TnnQ80Z71 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TnnQ80Z71 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TnnQ80Z71 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
TnnQ80Z71 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TnnQ80Z71 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TnnQ80Z71 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TnnQ80Z71 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TnnQ80Z71 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TnnQ80Z71 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TnnQ80Z71 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TnnQ80Z71 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TnnQ80Z71 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TnnQ80Z71 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TnnQ80Z71 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TnnQ80Z71 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
TnnQ80Z71 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
TnnQ80Z71 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
TnnQ80Z71 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
TnnQ80Z71 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TnnQ80Z71 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TnnQ80Z71 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TnnQ80Z71 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TnnQ80Z71 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TnnQ80Z71 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TnnQ80Z71 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TnnQ80Z71 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
TnnQ80Z71 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TnnQ80Z71 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TnnQ80Z71 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TnnQ80Z71 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TnnQ80Z71 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TnnQ80Z71 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TnnQ80Z71 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TnnQ80Z71 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
TnnQ80Z71 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TnnQ80Z71 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TnnQ80Z71 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TnnQ80Z71 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TnnQ80Z71 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TnnQ80Z71 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TnnQ80Z71 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
TnnQ80Z71 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TnnQ80Z71 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
TnnQ80Z71 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
TnnQ80Z71 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TnnQ80Z71 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TnnQ80Z71 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TnnQ80Z71 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TnnQ80Z71 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TnnQ80Z71 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TnnQ80Z71 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TnnQ80Z71 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TnnQ80Z71 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TnnQ80Z71 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TnnQ80Z71 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TnnQ80Z71 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
TnnQ80Z71 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TnnQ80Z71 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms