Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Zbed4Q80WQ9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zbed4Q80WQ9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zbed4Q80WQ9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zbed4Q80WQ9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zbed4Q80WQ9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zbed4Q80WQ9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zbed4Q80WQ9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zbed4Q80WQ9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zbed4Q80WQ9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Zbed4Q80WQ9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zbed4Q80WQ9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Zbed4Q80WQ9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zbed4Q80WQ9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zbed4Q80WQ9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zbed4Q80WQ9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zbed4Q80WQ9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zbed4Q80WQ9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zbed4Q80WQ9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zbed4Q80WQ9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zbed4Q80WQ9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zbed4Q80WQ9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zbed4Q80WQ9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zbed4Q80WQ9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zbed4Q80WQ9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zbed4Q80WQ9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zbed4Q80WQ9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zbed4Q80WQ9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zbed4Q80WQ9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zbed4Q80WQ9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zbed4Q80WQ9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zbed4Q80WQ9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zbed4Q80WQ9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zbed4Q80WQ9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zbed4Q80WQ9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Zbed4Q80WQ9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zbed4Q80WQ9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zbed4Q80WQ9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zbed4Q80WQ9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms