Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms