Protein–RNA interactions for Protein: Q80UW8

Polr2e, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2eQ80UW8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Polr2eQ80UW8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Polr2eQ80UW8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Polr2eQ80UW8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr2eQ80UW8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr2eQ80UW8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr2eQ80UW8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr2eQ80UW8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr2eQ80UW8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr2eQ80UW8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr2eQ80UW8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr2eQ80UW8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr2eQ80UW8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr2eQ80UW8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr2eQ80UW8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr2eQ80UW8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr2eQ80UW8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Polr2eQ80UW8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Polr2eQ80UW8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Polr2eQ80UW8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Polr2eQ80UW8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Polr2eQ80UW8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Polr2eQ80UW8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Polr2eQ80UW8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Polr2eQ80UW8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Polr2eQ80UW8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Polr2eQ80UW8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Polr2eQ80UW8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Polr2eQ80UW8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Polr2eQ80UW8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Polr2eQ80UW8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Polr2eQ80UW8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Polr2eQ80UW8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr2eQ80UW8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr2eQ80UW8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr2eQ80UW8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr2eQ80UW8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr2eQ80UW8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr2eQ80UW8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr2eQ80UW8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr2eQ80UW8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr2eQ80UW8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr2eQ80UW8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr2eQ80UW8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr2eQ80UW8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr2eQ80UW8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr2eQ80UW8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr2eQ80UW8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr2eQ80UW8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr2eQ80UW8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr2eQ80UW8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr2eQ80UW8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr2eQ80UW8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr2eQ80UW8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr2eQ80UW8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr2eQ80UW8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr2eQ80UW8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Polr2eQ80UW8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Polr2eQ80UW8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Polr2eQ80UW8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Polr2eQ80UW8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Polr2eQ80UW8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Polr2eQ80UW8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms