Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sestd1Q80UK0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sestd1Q80UK0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sestd1Q80UK0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sestd1Q80UK0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sestd1Q80UK0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sestd1Q80UK0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sestd1Q80UK0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sestd1Q80UK0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sestd1Q80UK0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sestd1Q80UK0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sestd1Q80UK0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sestd1Q80UK0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sestd1Q80UK0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sestd1Q80UK0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sestd1Q80UK0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sestd1Q80UK0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sestd1Q80UK0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sestd1Q80UK0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sestd1Q80UK0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sestd1Q80UK0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sestd1Q80UK0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sestd1Q80UK0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sestd1Q80UK0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sestd1Q80UK0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sestd1Q80UK0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sestd1Q80UK0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sestd1Q80UK0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sestd1Q80UK0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sestd1Q80UK0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sestd1Q80UK0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sestd1Q80UK0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sestd1Q80UK0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sestd1Q80UK0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sestd1Q80UK0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sestd1Q80UK0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sestd1Q80UK0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sestd1Q80UK0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sestd1Q80UK0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sestd1Q80UK0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sestd1Q80UK0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sestd1Q80UK0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sestd1Q80UK0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sestd1Q80UK0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sestd1Q80UK0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sestd1Q80UK0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sestd1Q80UK0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sestd1Q80UK0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sestd1Q80UK0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sestd1Q80UK0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sestd1Q80UK0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sestd1Q80UK0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sestd1Q80UK0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sestd1Q80UK0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sestd1Q80UK0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sestd1Q80UK0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sestd1Q80UK0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sestd1Q80UK0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sestd1Q80UK0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sestd1Q80UK0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sestd1Q80UK0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sestd1Q80UK0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sestd1Q80UK0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sestd1Q80UK0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sestd1Q80UK0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sestd1Q80UK0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sestd1Q80UK0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sestd1Q80UK0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sestd1Q80UK0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sestd1Q80UK0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sestd1Q80UK0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sestd1Q80UK0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sestd1Q80UK0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sestd1Q80UK0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sestd1Q80UK0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sestd1Q80UK0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sestd1Q80UK0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sestd1Q80UK0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sestd1Q80UK0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sestd1Q80UK0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sestd1Q80UK0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sestd1Q80UK0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sestd1Q80UK0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sestd1Q80UK0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sestd1Q80UK0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sestd1Q80UK0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sestd1Q80UK0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sestd1Q80UK0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sestd1Q80UK0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sestd1Q80UK0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sestd1Q80UK0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sestd1Q80UK0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sestd1Q80UK0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sestd1Q80UK0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sestd1Q80UK0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sestd1Q80UK0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sestd1Q80UK0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sestd1Q80UK0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sestd1Q80UK0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sestd1Q80UK0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms