Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF4

Sdccag8, Serologically defined colon cancer antigen 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdccag8Q80UF4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sdccag8Q80UF4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sdccag8Q80UF4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sdccag8Q80UF4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sdccag8Q80UF4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sdccag8Q80UF4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sdccag8Q80UF4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sdccag8Q80UF4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sdccag8Q80UF4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sdccag8Q80UF4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sdccag8Q80UF4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sdccag8Q80UF4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sdccag8Q80UF4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sdccag8Q80UF4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sdccag8Q80UF4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sdccag8Q80UF4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sdccag8Q80UF4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sdccag8Q80UF4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sdccag8Q80UF4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sdccag8Q80UF4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sdccag8Q80UF4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sdccag8Q80UF4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sdccag8Q80UF4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sdccag8Q80UF4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sdccag8Q80UF4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sdccag8Q80UF4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sdccag8Q80UF4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sdccag8Q80UF4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sdccag8Q80UF4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sdccag8Q80UF4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sdccag8Q80UF4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sdccag8Q80UF4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sdccag8Q80UF4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sdccag8Q80UF4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sdccag8Q80UF4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sdccag8Q80UF4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sdccag8Q80UF4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sdccag8Q80UF4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sdccag8Q80UF4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sdccag8Q80UF4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sdccag8Q80UF4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sdccag8Q80UF4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sdccag8Q80UF4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sdccag8Q80UF4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sdccag8Q80UF4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sdccag8Q80UF4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sdccag8Q80UF4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sdccag8Q80UF4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sdccag8Q80UF4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sdccag8Q80UF4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sdccag8Q80UF4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sdccag8Q80UF4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sdccag8Q80UF4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sdccag8Q80UF4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sdccag8Q80UF4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sdccag8Q80UF4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sdccag8Q80UF4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sdccag8Q80UF4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sdccag8Q80UF4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sdccag8Q80UF4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sdccag8Q80UF4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sdccag8Q80UF4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sdccag8Q80UF4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sdccag8Q80UF4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sdccag8Q80UF4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sdccag8Q80UF4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sdccag8Q80UF4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sdccag8Q80UF4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sdccag8Q80UF4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sdccag8Q80UF4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sdccag8Q80UF4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sdccag8Q80UF4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sdccag8Q80UF4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sdccag8Q80UF4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sdccag8Q80UF4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sdccag8Q80UF4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sdccag8Q80UF4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sdccag8Q80UF4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sdccag8Q80UF4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sdccag8Q80UF4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sdccag8Q80UF4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sdccag8Q80UF4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sdccag8Q80UF4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sdccag8Q80UF4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sdccag8Q80UF4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sdccag8Q80UF4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sdccag8Q80UF4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sdccag8Q80UF4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sdccag8Q80UF4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sdccag8Q80UF4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sdccag8Q80UF4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sdccag8Q80UF4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sdccag8Q80UF4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sdccag8Q80UF4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sdccag8Q80UF4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sdccag8Q80UF4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sdccag8Q80UF4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sdccag8Q80UF4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sdccag8Q80UF4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Sdccag8Q80UF4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms