Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ube3cQ80U95 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ube3cQ80U95 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ube3cQ80U95 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ube3cQ80U95 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ube3cQ80U95 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ube3cQ80U95 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ube3cQ80U95 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ube3cQ80U95 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ube3cQ80U95 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ube3cQ80U95 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ube3cQ80U95 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ube3cQ80U95 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ube3cQ80U95 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ube3cQ80U95 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ube3cQ80U95 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ube3cQ80U95 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ube3cQ80U95 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ube3cQ80U95 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ube3cQ80U95 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ube3cQ80U95 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ube3cQ80U95 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ube3cQ80U95 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ube3cQ80U95 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ube3cQ80U95 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ube3cQ80U95 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ube3cQ80U95 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ube3cQ80U95 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ube3cQ80U95 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ube3cQ80U95 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ube3cQ80U95 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ube3cQ80U95 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ube3cQ80U95 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ube3cQ80U95 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ube3cQ80U95 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ube3cQ80U95 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ube3cQ80U95 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ube3cQ80U95 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ube3cQ80U95 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ube3cQ80U95 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ube3cQ80U95 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ube3cQ80U95 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ube3cQ80U95 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ube3cQ80U95 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ube3cQ80U95 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ube3cQ80U95 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ube3cQ80U95 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ube3cQ80U95 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ube3cQ80U95 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ube3cQ80U95 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ube3cQ80U95 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ube3cQ80U95 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ube3cQ80U95 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ube3cQ80U95 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ube3cQ80U95 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ube3cQ80U95 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ube3cQ80U95 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ube3cQ80U95 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ube3cQ80U95 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ube3cQ80U95 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ube3cQ80U95 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ube3cQ80U95 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ube3cQ80U95 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ube3cQ80U95 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ube3cQ80U95 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ube3cQ80U95 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ube3cQ80U95 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ube3cQ80U95 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ube3cQ80U95 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ube3cQ80U95 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ube3cQ80U95 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ube3cQ80U95 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ube3cQ80U95 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ube3cQ80U95 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ube3cQ80U95 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ube3cQ80U95 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ube3cQ80U95 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ube3cQ80U95 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ube3cQ80U95 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ube3cQ80U95 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ube3cQ80U95 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ube3cQ80U95 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ube3cQ80U95 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ube3cQ80U95 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ube3cQ80U95 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ube3cQ80U95 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ube3cQ80U95 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ube3cQ80U95 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ube3cQ80U95 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ube3cQ80U95 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ube3cQ80U95 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ube3cQ80U95 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ube3cQ80U95 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ube3cQ80U95 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ube3cQ80U95 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ube3cQ80U95 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ube3cQ80U95 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ube3cQ80U95 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ube3cQ80U95 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ube3cQ80U95 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms