Protein–RNA interactions for Protein: Q80U49

Cep170b, Centrosomal protein of 170 kDa protein B, mousemouse

Predictions only

Length 1,574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170bQ80U49 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cep170bQ80U49 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cep170bQ80U49 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cep170bQ80U49 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cep170bQ80U49 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cep170bQ80U49 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cep170bQ80U49 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cep170bQ80U49 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cep170bQ80U49 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cep170bQ80U49 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cep170bQ80U49 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cep170bQ80U49 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cep170bQ80U49 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cep170bQ80U49 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cep170bQ80U49 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cep170bQ80U49 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cep170bQ80U49 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cep170bQ80U49 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cep170bQ80U49 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cep170bQ80U49 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cep170bQ80U49 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cep170bQ80U49 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cep170bQ80U49 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cep170bQ80U49 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cep170bQ80U49 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cep170bQ80U49 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cep170bQ80U49 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cep170bQ80U49 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cep170bQ80U49 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cep170bQ80U49 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cep170bQ80U49 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cep170bQ80U49 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cep170bQ80U49 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cep170bQ80U49 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cep170bQ80U49 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cep170bQ80U49 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cep170bQ80U49 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cep170bQ80U49 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cep170bQ80U49 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cep170bQ80U49 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cep170bQ80U49 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cep170bQ80U49 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cep170bQ80U49 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cep170bQ80U49 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cep170bQ80U49 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Cep170bQ80U49 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cep170bQ80U49 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cep170bQ80U49 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cep170bQ80U49 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cep170bQ80U49 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cep170bQ80U49 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cep170bQ80U49 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cep170bQ80U49 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Cep170bQ80U49 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cep170bQ80U49 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cep170bQ80U49 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Cep170bQ80U49 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cep170bQ80U49 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cep170bQ80U49 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cep170bQ80U49 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cep170bQ80U49 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cep170bQ80U49 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cep170bQ80U49 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cep170bQ80U49 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cep170bQ80U49 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cep170bQ80U49 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cep170bQ80U49 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cep170bQ80U49 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cep170bQ80U49 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cep170bQ80U49 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cep170bQ80U49 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Cep170bQ80U49 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cep170bQ80U49 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cep170bQ80U49 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cep170bQ80U49 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Cep170bQ80U49 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cep170bQ80U49 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cep170bQ80U49 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cep170bQ80U49 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cep170bQ80U49 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cep170bQ80U49 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cep170bQ80U49 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cep170bQ80U49 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cep170bQ80U49 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Cep170bQ80U49 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cep170bQ80U49 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cep170bQ80U49 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cep170bQ80U49 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cep170bQ80U49 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cep170bQ80U49 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cep170bQ80U49 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cep170bQ80U49 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cep170bQ80U49 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cep170bQ80U49 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cep170bQ80U49 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cep170bQ80U49 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cep170bQ80U49 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cep170bQ80U49 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cep170bQ80U49 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cep170bQ80U49 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms