Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
NischQ80TM9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC43.04■■■■■ 4.48
NischQ80TM9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
NischQ80TM9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.04■■■■■ 4.48
NischQ80TM9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
NischQ80TM9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
NischQ80TM9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
NischQ80TM9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.03■■■■■ 4.48
NischQ80TM9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC43.03■■■■■ 4.48
NischQ80TM9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC43.02■■■■■ 4.48
NischQ80TM9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
NischQ80TM9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
NischQ80TM9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
NischQ80TM9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
NischQ80TM9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
NischQ80TM9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.01■■■■■ 4.48
NischQ80TM9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.47
NischQ80TM9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
NischQ80TM9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
NischQ80TM9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
NischQ80TM9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
NischQ80TM9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
NischQ80TM9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.99■■■■■ 4.47
NischQ80TM9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.99■■■■■ 4.47
NischQ80TM9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC42.98■■■■■ 4.47
NischQ80TM9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
NischQ80TM9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
NischQ80TM9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
NischQ80TM9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC42.95■■■■■ 4.47
NischQ80TM9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC42.95■■■■■ 4.47
NischQ80TM9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC42.95■■■■■ 4.47
NischQ80TM9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.47
NischQ80TM9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
NischQ80TM9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC42.94■■■■■ 4.46
NischQ80TM9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
NischQ80TM9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
NischQ80TM9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
NischQ80TM9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
NischQ80TM9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
NischQ80TM9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
NischQ80TM9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
NischQ80TM9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
NischQ80TM9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
NischQ80TM9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
NischQ80TM9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.91■■■■■ 4.46
NischQ80TM9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
NischQ80TM9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
NischQ80TM9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
NischQ80TM9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC42.91■■■■■ 4.46
NischQ80TM9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
NischQ80TM9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
NischQ80TM9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC42.9■■■■■ 4.46
NischQ80TM9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
NischQ80TM9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.9■■■■■ 4.46
NischQ80TM9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC42.9■■■■■ 4.46
NischQ80TM9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC42.9■■■■■ 4.46
NischQ80TM9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
NischQ80TM9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.89■■■■■ 4.46
NischQ80TM9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
NischQ80TM9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
NischQ80TM9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
NischQ80TM9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
NischQ80TM9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC42.88■■■■■ 4.45
NischQ80TM9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
NischQ80TM9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
NischQ80TM9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
NischQ80TM9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
NischQ80TM9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
NischQ80TM9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC42.87■■■■■ 4.45
NischQ80TM9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
NischQ80TM9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
NischQ80TM9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
NischQ80TM9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
NischQ80TM9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC42.86■■■■■ 4.45
NischQ80TM9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.86■■■■■ 4.45
NischQ80TM9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
NischQ80TM9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC42.86■■■■■ 4.45
NischQ80TM9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
NischQ80TM9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
NischQ80TM9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
NischQ80TM9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC42.85■■■■■ 4.45
NischQ80TM9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
NischQ80TM9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
NischQ80TM9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC42.84■■■■■ 4.45
NischQ80TM9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
NischQ80TM9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
NischQ80TM9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
NischQ80TM9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
NischQ80TM9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
NischQ80TM9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC42.82■■■■■ 4.45
NischQ80TM9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
NischQ80TM9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
NischQ80TM9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.44
NischQ80TM9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
NischQ80TM9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.81■■■■■ 4.44
NischQ80TM9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
NischQ80TM9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC42.81■■■■■ 4.44
NischQ80TM9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
NischQ80TM9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
NischQ80TM9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC42.8■■■■■ 4.44
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