Protein–RNA interactions for Protein: Q80T74

Klhl29, Kelch-like protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl29Q80T74 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhl29Q80T74 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhl29Q80T74 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhl29Q80T74 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhl29Q80T74 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl29Q80T74 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl29Q80T74 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl29Q80T74 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl29Q80T74 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl29Q80T74 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl29Q80T74 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl29Q80T74 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl29Q80T74 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl29Q80T74 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl29Q80T74 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl29Q80T74 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl29Q80T74 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl29Q80T74 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl29Q80T74 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl29Q80T74 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl29Q80T74 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl29Q80T74 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl29Q80T74 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl29Q80T74 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl29Q80T74 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl29Q80T74 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl29Q80T74 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl29Q80T74 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl29Q80T74 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl29Q80T74 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl29Q80T74 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl29Q80T74 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl29Q80T74 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl29Q80T74 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl29Q80T74 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl29Q80T74 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl29Q80T74 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl29Q80T74 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl29Q80T74 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl29Q80T74 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl29Q80T74 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl29Q80T74 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl29Q80T74 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhl29Q80T74 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhl29Q80T74 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhl29Q80T74 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhl29Q80T74 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl29Q80T74 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl29Q80T74 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl29Q80T74 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl29Q80T74 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl29Q80T74 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl29Q80T74 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl29Q80T74 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl29Q80T74 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl29Q80T74 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl29Q80T74 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl29Q80T74 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl29Q80T74 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl29Q80T74 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl29Q80T74 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl29Q80T74 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl29Q80T74 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl29Q80T74 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl29Q80T74 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl29Q80T74 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl29Q80T74 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl29Q80T74 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl29Q80T74 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl29Q80T74 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl29Q80T74 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl29Q80T74 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl29Q80T74 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl29Q80T74 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl29Q80T74 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl29Q80T74 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl29Q80T74 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl29Q80T74 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl29Q80T74 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl29Q80T74 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl29Q80T74 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl29Q80T74 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl29Q80T74 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl29Q80T74 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl29Q80T74 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl29Q80T74 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl29Q80T74 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl29Q80T74 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl29Q80T74 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl29Q80T74 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl29Q80T74 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl29Q80T74 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl29Q80T74 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl29Q80T74 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl29Q80T74 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl29Q80T74 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl29Q80T74 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl29Q80T74 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl29Q80T74 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl29Q80T74 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.5 ms