Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube2q1Q7TSS2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube2q1Q7TSS2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube2q1Q7TSS2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube2q1Q7TSS2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube2q1Q7TSS2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube2q1Q7TSS2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube2q1Q7TSS2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube2q1Q7TSS2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube2q1Q7TSS2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube2q1Q7TSS2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube2q1Q7TSS2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube2q1Q7TSS2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube2q1Q7TSS2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube2q1Q7TSS2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube2q1Q7TSS2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ube2q1Q7TSS2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ube2q1Q7TSS2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ube2q1Q7TSS2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube2q1Q7TSS2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube2q1Q7TSS2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube2q1Q7TSS2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube2q1Q7TSS2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube2q1Q7TSS2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube2q1Q7TSS2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube2q1Q7TSS2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube2q1Q7TSS2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube2q1Q7TSS2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube2q1Q7TSS2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube2q1Q7TSS2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube2q1Q7TSS2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube2q1Q7TSS2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube2q1Q7TSS2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube2q1Q7TSS2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube2q1Q7TSS2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube2q1Q7TSS2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube2q1Q7TSS2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ube2q1Q7TSS2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ube2q1Q7TSS2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ube2q1Q7TSS2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube2q1Q7TSS2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube2q1Q7TSS2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube2q1Q7TSS2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube2q1Q7TSS2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube2q1Q7TSS2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube2q1Q7TSS2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube2q1Q7TSS2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube2q1Q7TSS2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube2q1Q7TSS2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube2q1Q7TSS2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube2q1Q7TSS2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube2q1Q7TSS2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube2q1Q7TSS2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube2q1Q7TSS2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube2q1Q7TSS2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube2q1Q7TSS2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube2q1Q7TSS2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube2q1Q7TSS2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube2q1Q7TSS2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube2q1Q7TSS2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube2q1Q7TSS2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube2q1Q7TSS2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube2q1Q7TSS2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube2q1Q7TSS2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube2q1Q7TSS2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube2q1Q7TSS2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube2q1Q7TSS2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube2q1Q7TSS2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube2q1Q7TSS2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube2q1Q7TSS2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube2q1Q7TSS2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube2q1Q7TSS2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube2q1Q7TSS2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube2q1Q7TSS2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube2q1Q7TSS2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube2q1Q7TSS2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube2q1Q7TSS2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube2q1Q7TSS2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube2q1Q7TSS2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube2q1Q7TSS2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube2q1Q7TSS2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube2q1Q7TSS2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube2q1Q7TSS2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube2q1Q7TSS2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube2q1Q7TSS2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube2q1Q7TSS2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube2q1Q7TSS2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube2q1Q7TSS2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube2q1Q7TSS2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube2q1Q7TSS2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube2q1Q7TSS2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube2q1Q7TSS2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube2q1Q7TSS2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube2q1Q7TSS2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube2q1Q7TSS2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ube2q1Q7TSS2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ube2q1Q7TSS2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ube2q1Q7TSS2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ube2q1Q7TSS2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ube2q1Q7TSS2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms