Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH3

Znf516, Zinc finger protein 516, mousemouse

Predictions only

Length 1,157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf516Q7TSH3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Znf516Q7TSH3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Znf516Q7TSH3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Znf516Q7TSH3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Znf516Q7TSH3 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Znf516Q7TSH3 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Znf516Q7TSH3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Znf516Q7TSH3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Znf516Q7TSH3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Znf516Q7TSH3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Znf516Q7TSH3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Znf516Q7TSH3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Znf516Q7TSH3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Znf516Q7TSH3 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Znf516Q7TSH3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Znf516Q7TSH3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Znf516Q7TSH3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Znf516Q7TSH3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Znf516Q7TSH3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Znf516Q7TSH3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Znf516Q7TSH3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Znf516Q7TSH3 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Znf516Q7TSH3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Znf516Q7TSH3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Znf516Q7TSH3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Znf516Q7TSH3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Znf516Q7TSH3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Znf516Q7TSH3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Znf516Q7TSH3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Znf516Q7TSH3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Znf516Q7TSH3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Znf516Q7TSH3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Znf516Q7TSH3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Znf516Q7TSH3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Znf516Q7TSH3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Znf516Q7TSH3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Znf516Q7TSH3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Znf516Q7TSH3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Znf516Q7TSH3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Znf516Q7TSH3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Znf516Q7TSH3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Znf516Q7TSH3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Znf516Q7TSH3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Znf516Q7TSH3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Znf516Q7TSH3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Znf516Q7TSH3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Znf516Q7TSH3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Znf516Q7TSH3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Znf516Q7TSH3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Znf516Q7TSH3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Znf516Q7TSH3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Znf516Q7TSH3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Znf516Q7TSH3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Znf516Q7TSH3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Znf516Q7TSH3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Znf516Q7TSH3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Znf516Q7TSH3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Znf516Q7TSH3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms