Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ckap2lQ7TS74 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ckap2lQ7TS74 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ckap2lQ7TS74 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ckap2lQ7TS74 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ckap2lQ7TS74 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ckap2lQ7TS74 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ckap2lQ7TS74 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ckap2lQ7TS74 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ckap2lQ7TS74 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ckap2lQ7TS74 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ckap2lQ7TS74 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ckap2lQ7TS74 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ckap2lQ7TS74 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ckap2lQ7TS74 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ckap2lQ7TS74 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ckap2lQ7TS74 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ckap2lQ7TS74 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ckap2lQ7TS74 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ckap2lQ7TS74 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ckap2lQ7TS74 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ckap2lQ7TS74 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ckap2lQ7TS74 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ckap2lQ7TS74 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ckap2lQ7TS74 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ckap2lQ7TS74 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ckap2lQ7TS74 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ckap2lQ7TS74 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ckap2lQ7TS74 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ckap2lQ7TS74 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ckap2lQ7TS74 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ckap2lQ7TS74 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ckap2lQ7TS74 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ckap2lQ7TS74 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ckap2lQ7TS74 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ckap2lQ7TS74 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ckap2lQ7TS74 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ckap2lQ7TS74 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ckap2lQ7TS74 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ckap2lQ7TS74 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ckap2lQ7TS74 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ckap2lQ7TS74 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms