Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPG0

1700010I14Rik, GI:13385330, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700010I14RikQ7TPG0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
1700010I14RikQ7TPG0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
1700010I14RikQ7TPG0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
1700010I14RikQ7TPG0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
1700010I14RikQ7TPG0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
1700010I14RikQ7TPG0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
1700010I14RikQ7TPG0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
1700010I14RikQ7TPG0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
1700010I14RikQ7TPG0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
1700010I14RikQ7TPG0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
1700010I14RikQ7TPG0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
1700010I14RikQ7TPG0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
1700010I14RikQ7TPG0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
1700010I14RikQ7TPG0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
1700010I14RikQ7TPG0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
1700010I14RikQ7TPG0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
1700010I14RikQ7TPG0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
1700010I14RikQ7TPG0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
1700010I14RikQ7TPG0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
1700010I14RikQ7TPG0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
1700010I14RikQ7TPG0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
1700010I14RikQ7TPG0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
1700010I14RikQ7TPG0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
1700010I14RikQ7TPG0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
1700010I14RikQ7TPG0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
1700010I14RikQ7TPG0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
1700010I14RikQ7TPG0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
1700010I14RikQ7TPG0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
1700010I14RikQ7TPG0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
1700010I14RikQ7TPG0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
1700010I14RikQ7TPG0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
1700010I14RikQ7TPG0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
1700010I14RikQ7TPG0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
1700010I14RikQ7TPG0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
1700010I14RikQ7TPG0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
1700010I14RikQ7TPG0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
1700010I14RikQ7TPG0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
1700010I14RikQ7TPG0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
1700010I14RikQ7TPG0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
1700010I14RikQ7TPG0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
1700010I14RikQ7TPG0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
1700010I14RikQ7TPG0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
1700010I14RikQ7TPG0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
1700010I14RikQ7TPG0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
1700010I14RikQ7TPG0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
1700010I14RikQ7TPG0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
1700010I14RikQ7TPG0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
1700010I14RikQ7TPG0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
1700010I14RikQ7TPG0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
1700010I14RikQ7TPG0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
1700010I14RikQ7TPG0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
1700010I14RikQ7TPG0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
1700010I14RikQ7TPG0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
1700010I14RikQ7TPG0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
1700010I14RikQ7TPG0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
1700010I14RikQ7TPG0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
1700010I14RikQ7TPG0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
1700010I14RikQ7TPG0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
1700010I14RikQ7TPG0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
1700010I14RikQ7TPG0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
1700010I14RikQ7TPG0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
1700010I14RikQ7TPG0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
1700010I14RikQ7TPG0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
1700010I14RikQ7TPG0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
1700010I14RikQ7TPG0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
1700010I14RikQ7TPG0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
1700010I14RikQ7TPG0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
1700010I14RikQ7TPG0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
1700010I14RikQ7TPG0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
1700010I14RikQ7TPG0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
1700010I14RikQ7TPG0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
1700010I14RikQ7TPG0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
1700010I14RikQ7TPG0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
1700010I14RikQ7TPG0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
1700010I14RikQ7TPG0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
1700010I14RikQ7TPG0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
1700010I14RikQ7TPG0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
1700010I14RikQ7TPG0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
1700010I14RikQ7TPG0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
1700010I14RikQ7TPG0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
1700010I14RikQ7TPG0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
1700010I14RikQ7TPG0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
1700010I14RikQ7TPG0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
1700010I14RikQ7TPG0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
1700010I14RikQ7TPG0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
1700010I14RikQ7TPG0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
1700010I14RikQ7TPG0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
1700010I14RikQ7TPG0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
1700010I14RikQ7TPG0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
1700010I14RikQ7TPG0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
1700010I14RikQ7TPG0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
1700010I14RikQ7TPG0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
1700010I14RikQ7TPG0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
1700010I14RikQ7TPG0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
1700010I14RikQ7TPG0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
1700010I14RikQ7TPG0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
1700010I14RikQ7TPG0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
1700010I14RikQ7TPG0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
1700010I14RikQ7TPG0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
1700010I14RikQ7TPG0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms