Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPC1

Cdsn, Corneodesmosin, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdsnQ7TPC1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CdsnQ7TPC1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CdsnQ7TPC1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CdsnQ7TPC1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CdsnQ7TPC1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CdsnQ7TPC1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CdsnQ7TPC1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CdsnQ7TPC1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CdsnQ7TPC1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CdsnQ7TPC1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CdsnQ7TPC1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms