Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nphp3Q7TNH6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nphp3Q7TNH6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Nphp3Q7TNH6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nphp3Q7TNH6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nphp3Q7TNH6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nphp3Q7TNH6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nphp3Q7TNH6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Nphp3Q7TNH6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nphp3Q7TNH6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nphp3Q7TNH6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nphp3Q7TNH6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nphp3Q7TNH6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nphp3Q7TNH6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nphp3Q7TNH6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nphp3Q7TNH6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nphp3Q7TNH6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nphp3Q7TNH6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nphp3Q7TNH6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nphp3Q7TNH6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nphp3Q7TNH6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nphp3Q7TNH6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Nphp3Q7TNH6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nphp3Q7TNH6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nphp3Q7TNH6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Nphp3Q7TNH6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nphp3Q7TNH6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Nphp3Q7TNH6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nphp3Q7TNH6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nphp3Q7TNH6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nphp3Q7TNH6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nphp3Q7TNH6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nphp3Q7TNH6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nphp3Q7TNH6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nphp3Q7TNH6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nphp3Q7TNH6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nphp3Q7TNH6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Nphp3Q7TNH6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nphp3Q7TNH6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nphp3Q7TNH6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nphp3Q7TNH6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nphp3Q7TNH6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nphp3Q7TNH6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nphp3Q7TNH6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nphp3Q7TNH6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nphp3Q7TNH6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nphp3Q7TNH6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nphp3Q7TNH6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nphp3Q7TNH6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nphp3Q7TNH6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nphp3Q7TNH6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nphp3Q7TNH6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nphp3Q7TNH6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nphp3Q7TNH6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Nphp3Q7TNH6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Nphp3Q7TNH6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nphp3Q7TNH6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nphp3Q7TNH6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nphp3Q7TNH6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nphp3Q7TNH6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nphp3Q7TNH6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nphp3Q7TNH6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nphp3Q7TNH6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nphp3Q7TNH6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nphp3Q7TNH6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nphp3Q7TNH6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Nphp3Q7TNH6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nphp3Q7TNH6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nphp3Q7TNH6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nphp3Q7TNH6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nphp3Q7TNH6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nphp3Q7TNH6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nphp3Q7TNH6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nphp3Q7TNH6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nphp3Q7TNH6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nphp3Q7TNH6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nphp3Q7TNH6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nphp3Q7TNH6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nphp3Q7TNH6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nphp3Q7TNH6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nphp3Q7TNH6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nphp3Q7TNH6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nphp3Q7TNH6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nphp3Q7TNH6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nphp3Q7TNH6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nphp3Q7TNH6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nphp3Q7TNH6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nphp3Q7TNH6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nphp3Q7TNH6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nphp3Q7TNH6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nphp3Q7TNH6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nphp3Q7TNH6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nphp3Q7TNH6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Nphp3Q7TNH6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nphp3Q7TNH6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nphp3Q7TNH6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nphp3Q7TNH6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nphp3Q7TNH6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Nphp3Q7TNH6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Nphp3Q7TNH6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms