Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdcl2Q78Y63 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdcl2Q78Y63 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdcl2Q78Y63 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pdcl2Q78Y63 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdcl2Q78Y63 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdcl2Q78Y63 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdcl2Q78Y63 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdcl2Q78Y63 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdcl2Q78Y63 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdcl2Q78Y63 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdcl2Q78Y63 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdcl2Q78Y63 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdcl2Q78Y63 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdcl2Q78Y63 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdcl2Q78Y63 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdcl2Q78Y63 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdcl2Q78Y63 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdcl2Q78Y63 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdcl2Q78Y63 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdcl2Q78Y63 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdcl2Q78Y63 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdcl2Q78Y63 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdcl2Q78Y63 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdcl2Q78Y63 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdcl2Q78Y63 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdcl2Q78Y63 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdcl2Q78Y63 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdcl2Q78Y63 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdcl2Q78Y63 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdcl2Q78Y63 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdcl2Q78Y63 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdcl2Q78Y63 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcl2Q78Y63 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcl2Q78Y63 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcl2Q78Y63 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcl2Q78Y63 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcl2Q78Y63 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcl2Q78Y63 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcl2Q78Y63 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcl2Q78Y63 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcl2Q78Y63 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcl2Q78Y63 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcl2Q78Y63 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcl2Q78Y63 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcl2Q78Y63 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdcl2Q78Y63 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdcl2Q78Y63 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdcl2Q78Y63 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdcl2Q78Y63 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdcl2Q78Y63 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdcl2Q78Y63 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdcl2Q78Y63 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdcl2Q78Y63 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdcl2Q78Y63 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdcl2Q78Y63 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdcl2Q78Y63 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdcl2Q78Y63 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdcl2Q78Y63 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdcl2Q78Y63 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdcl2Q78Y63 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdcl2Q78Y63 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdcl2Q78Y63 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdcl2Q78Y63 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdcl2Q78Y63 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdcl2Q78Y63 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdcl2Q78Y63 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdcl2Q78Y63 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdcl2Q78Y63 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdcl2Q78Y63 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdcl2Q78Y63 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdcl2Q78Y63 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdcl2Q78Y63 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdcl2Q78Y63 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdcl2Q78Y63 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdcl2Q78Y63 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdcl2Q78Y63 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdcl2Q78Y63 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdcl2Q78Y63 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdcl2Q78Y63 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdcl2Q78Y63 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdcl2Q78Y63 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdcl2Q78Y63 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdcl2Q78Y63 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdcl2Q78Y63 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdcl2Q78Y63 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdcl2Q78Y63 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdcl2Q78Y63 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdcl2Q78Y63 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdcl2Q78Y63 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdcl2Q78Y63 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdcl2Q78Y63 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdcl2Q78Y63 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdcl2Q78Y63 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdcl2Q78Y63 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdcl2Q78Y63 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdcl2Q78Y63 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdcl2Q78Y63 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdcl2Q78Y63 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdcl2Q78Y63 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms