Protein–RNA interactions for Protein: Q76I79

Ssh1, Protein phosphatase Slingshot homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh1Q76I79 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ssh1Q76I79 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ssh1Q76I79 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ssh1Q76I79 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ssh1Q76I79 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ssh1Q76I79 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ssh1Q76I79 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ssh1Q76I79 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ssh1Q76I79 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ssh1Q76I79 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ssh1Q76I79 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ssh1Q76I79 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ssh1Q76I79 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ssh1Q76I79 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ssh1Q76I79 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ssh1Q76I79 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ssh1Q76I79 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ssh1Q76I79 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ssh1Q76I79 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ssh1Q76I79 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ssh1Q76I79 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ssh1Q76I79 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ssh1Q76I79 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ssh1Q76I79 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ssh1Q76I79 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ssh1Q76I79 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ssh1Q76I79 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ssh1Q76I79 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ssh1Q76I79 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ssh1Q76I79 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ssh1Q76I79 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ssh1Q76I79 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ssh1Q76I79 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ssh1Q76I79 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ssh1Q76I79 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ssh1Q76I79 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ssh1Q76I79 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ssh1Q76I79 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ssh1Q76I79 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ssh1Q76I79 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ssh1Q76I79 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ssh1Q76I79 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ssh1Q76I79 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ssh1Q76I79 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ssh1Q76I79 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ssh1Q76I79 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ssh1Q76I79 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ssh1Q76I79 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ssh1Q76I79 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ssh1Q76I79 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ssh1Q76I79 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ssh1Q76I79 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ssh1Q76I79 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ssh1Q76I79 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ssh1Q76I79 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ssh1Q76I79 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ssh1Q76I79 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ssh1Q76I79 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ssh1Q76I79 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ssh1Q76I79 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ssh1Q76I79 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ssh1Q76I79 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ssh1Q76I79 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ssh1Q76I79 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ssh1Q76I79 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ssh1Q76I79 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ssh1Q76I79 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ssh1Q76I79 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ssh1Q76I79 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ssh1Q76I79 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ssh1Q76I79 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ssh1Q76I79 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ssh1Q76I79 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ssh1Q76I79 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ssh1Q76I79 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ssh1Q76I79 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ssh1Q76I79 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ssh1Q76I79 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ssh1Q76I79 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ssh1Q76I79 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ssh1Q76I79 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ssh1Q76I79 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ssh1Q76I79 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ssh1Q76I79 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ssh1Q76I79 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ssh1Q76I79 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ssh1Q76I79 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ssh1Q76I79 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ssh1Q76I79 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ssh1Q76I79 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ssh1Q76I79 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ssh1Q76I79 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ssh1Q76I79 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ssh1Q76I79 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ssh1Q76I79 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ssh1Q76I79 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ssh1Q76I79 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ssh1Q76I79 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ssh1Q76I79 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ssh1Q76I79 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms