Protein–RNA interactions for Protein: Q70E20

Sned1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sned1Q70E20 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sned1Q70E20 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sned1Q70E20 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sned1Q70E20 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sned1Q70E20 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Sned1Q70E20 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Sned1Q70E20 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sned1Q70E20 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sned1Q70E20 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sned1Q70E20 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sned1Q70E20 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sned1Q70E20 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sned1Q70E20 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sned1Q70E20 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sned1Q70E20 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sned1Q70E20 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sned1Q70E20 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sned1Q70E20 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sned1Q70E20 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sned1Q70E20 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sned1Q70E20 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sned1Q70E20 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sned1Q70E20 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sned1Q70E20 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Sned1Q70E20 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sned1Q70E20 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sned1Q70E20 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sned1Q70E20 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sned1Q70E20 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sned1Q70E20 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Sned1Q70E20 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sned1Q70E20 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sned1Q70E20 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sned1Q70E20 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sned1Q70E20 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Sned1Q70E20 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sned1Q70E20 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sned1Q70E20 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sned1Q70E20 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sned1Q70E20 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sned1Q70E20 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sned1Q70E20 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sned1Q70E20 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sned1Q70E20 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sned1Q70E20 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sned1Q70E20 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sned1Q70E20 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sned1Q70E20 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sned1Q70E20 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sned1Q70E20 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sned1Q70E20 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sned1Q70E20 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sned1Q70E20 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sned1Q70E20 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Sned1Q70E20 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sned1Q70E20 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Sned1Q70E20 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sned1Q70E20 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sned1Q70E20 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Sned1Q70E20 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sned1Q70E20 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sned1Q70E20 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sned1Q70E20 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sned1Q70E20 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sned1Q70E20 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sned1Q70E20 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sned1Q70E20 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sned1Q70E20 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sned1Q70E20 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sned1Q70E20 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sned1Q70E20 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sned1Q70E20 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sned1Q70E20 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sned1Q70E20 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sned1Q70E20 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sned1Q70E20 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sned1Q70E20 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sned1Q70E20 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sned1Q70E20 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sned1Q70E20 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sned1Q70E20 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sned1Q70E20 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sned1Q70E20 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sned1Q70E20 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sned1Q70E20 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sned1Q70E20 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sned1Q70E20 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sned1Q70E20 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sned1Q70E20 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sned1Q70E20 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Sned1Q70E20 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sned1Q70E20 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sned1Q70E20 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sned1Q70E20 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sned1Q70E20 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sned1Q70E20 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Sned1Q70E20 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sned1Q70E20 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sned1Q70E20 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sned1Q70E20 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms