Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Topbp1Q6ZQF0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Topbp1Q6ZQF0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Topbp1Q6ZQF0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Topbp1Q6ZQF0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Topbp1Q6ZQF0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Topbp1Q6ZQF0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Topbp1Q6ZQF0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Topbp1Q6ZQF0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Topbp1Q6ZQF0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Topbp1Q6ZQF0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Topbp1Q6ZQF0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Topbp1Q6ZQF0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Topbp1Q6ZQF0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Topbp1Q6ZQF0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Topbp1Q6ZQF0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Topbp1Q6ZQF0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Topbp1Q6ZQF0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Topbp1Q6ZQF0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Topbp1Q6ZQF0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Topbp1Q6ZQF0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Topbp1Q6ZQF0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Topbp1Q6ZQF0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Topbp1Q6ZQF0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Topbp1Q6ZQF0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Topbp1Q6ZQF0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Topbp1Q6ZQF0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Topbp1Q6ZQF0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Topbp1Q6ZQF0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Topbp1Q6ZQF0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Topbp1Q6ZQF0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Topbp1Q6ZQF0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Topbp1Q6ZQF0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Topbp1Q6ZQF0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Topbp1Q6ZQF0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Topbp1Q6ZQF0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Topbp1Q6ZQF0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Topbp1Q6ZQF0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Topbp1Q6ZQF0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Topbp1Q6ZQF0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Topbp1Q6ZQF0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Topbp1Q6ZQF0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Topbp1Q6ZQF0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Topbp1Q6ZQF0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Topbp1Q6ZQF0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Topbp1Q6ZQF0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Topbp1Q6ZQF0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Topbp1Q6ZQF0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Topbp1Q6ZQF0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Topbp1Q6ZQF0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Topbp1Q6ZQF0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Topbp1Q6ZQF0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Topbp1Q6ZQF0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Topbp1Q6ZQF0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Topbp1Q6ZQF0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Topbp1Q6ZQF0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
Topbp1Q6ZQF0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Topbp1Q6ZQF0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Topbp1Q6ZQF0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Topbp1Q6ZQF0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Topbp1Q6ZQF0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Topbp1Q6ZQF0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Topbp1Q6ZQF0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Topbp1Q6ZQF0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Topbp1Q6ZQF0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Topbp1Q6ZQF0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Topbp1Q6ZQF0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Topbp1Q6ZQF0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Topbp1Q6ZQF0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Topbp1Q6ZQF0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Topbp1Q6ZQF0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Topbp1Q6ZQF0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Topbp1Q6ZQF0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Topbp1Q6ZQF0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Topbp1Q6ZQF0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Topbp1Q6ZQF0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Topbp1Q6ZQF0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Topbp1Q6ZQF0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Topbp1Q6ZQF0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Topbp1Q6ZQF0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Topbp1Q6ZQF0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Topbp1Q6ZQF0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Topbp1Q6ZQF0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Topbp1Q6ZQF0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Topbp1Q6ZQF0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Topbp1Q6ZQF0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Topbp1Q6ZQF0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Topbp1Q6ZQF0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Topbp1Q6ZQF0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Topbp1Q6ZQF0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Topbp1Q6ZQF0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Topbp1Q6ZQF0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Topbp1Q6ZQF0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Topbp1Q6ZQF0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Topbp1Q6ZQF0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms