Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms