Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp34Q6ZQ93 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp34Q6ZQ93 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp34Q6ZQ93 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp34Q6ZQ93 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp34Q6ZQ93 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp34Q6ZQ93 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp34Q6ZQ93 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp34Q6ZQ93 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp34Q6ZQ93 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp34Q6ZQ93 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp34Q6ZQ93 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp34Q6ZQ93 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp34Q6ZQ93 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp34Q6ZQ93 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp34Q6ZQ93 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp34Q6ZQ93 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp34Q6ZQ93 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp34Q6ZQ93 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp34Q6ZQ93 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp34Q6ZQ93 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp34Q6ZQ93 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp34Q6ZQ93 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp34Q6ZQ93 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp34Q6ZQ93 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp34Q6ZQ93 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp34Q6ZQ93 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp34Q6ZQ93 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp34Q6ZQ93 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp34Q6ZQ93 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp34Q6ZQ93 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp34Q6ZQ93 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp34Q6ZQ93 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp34Q6ZQ93 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp34Q6ZQ93 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp34Q6ZQ93 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp34Q6ZQ93 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp34Q6ZQ93 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp34Q6ZQ93 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp34Q6ZQ93 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp34Q6ZQ93 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp34Q6ZQ93 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp34Q6ZQ93 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp34Q6ZQ93 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp34Q6ZQ93 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp34Q6ZQ93 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp34Q6ZQ93 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp34Q6ZQ93 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp34Q6ZQ93 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp34Q6ZQ93 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp34Q6ZQ93 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp34Q6ZQ93 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp34Q6ZQ93 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp34Q6ZQ93 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp34Q6ZQ93 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp34Q6ZQ93 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp34Q6ZQ93 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp34Q6ZQ93 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp34Q6ZQ93 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp34Q6ZQ93 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Usp34Q6ZQ93 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Usp34Q6ZQ93 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Usp34Q6ZQ93 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Usp34Q6ZQ93 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp34Q6ZQ93 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp34Q6ZQ93 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp34Q6ZQ93 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp34Q6ZQ93 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp34Q6ZQ93 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp34Q6ZQ93 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp34Q6ZQ93 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp34Q6ZQ93 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp34Q6ZQ93 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp34Q6ZQ93 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp34Q6ZQ93 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp34Q6ZQ93 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp34Q6ZQ93 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp34Q6ZQ93 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp34Q6ZQ93 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp34Q6ZQ93 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp34Q6ZQ93 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp34Q6ZQ93 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp34Q6ZQ93 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp34Q6ZQ93 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp34Q6ZQ93 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp34Q6ZQ93 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp34Q6ZQ93 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp34Q6ZQ93 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp34Q6ZQ93 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp34Q6ZQ93 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp34Q6ZQ93 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp34Q6ZQ93 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp34Q6ZQ93 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp34Q6ZQ93 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp34Q6ZQ93 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp34Q6ZQ93 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp34Q6ZQ93 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp34Q6ZQ93 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp34Q6ZQ93 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp34Q6ZQ93 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms