Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ18

Efr3b, Protein EFR3 homolog B, mousemouse

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Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3bQ6ZQ18 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Efr3bQ6ZQ18 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Efr3bQ6ZQ18 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Efr3bQ6ZQ18 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Efr3bQ6ZQ18 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Efr3bQ6ZQ18 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Efr3bQ6ZQ18 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Efr3bQ6ZQ18 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Efr3bQ6ZQ18 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Efr3bQ6ZQ18 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Efr3bQ6ZQ18 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Efr3bQ6ZQ18 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Efr3bQ6ZQ18 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Efr3bQ6ZQ18 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Efr3bQ6ZQ18 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Efr3bQ6ZQ18 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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Efr3bQ6ZQ18 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
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Efr3bQ6ZQ18 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Efr3bQ6ZQ18 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Efr3bQ6ZQ18 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Efr3bQ6ZQ18 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Efr3bQ6ZQ18 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Efr3bQ6ZQ18 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Efr3bQ6ZQ18 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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Efr3bQ6ZQ18 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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Efr3bQ6ZQ18 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Efr3bQ6ZQ18 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Efr3bQ6ZQ18 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Efr3bQ6ZQ18 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Efr3bQ6ZQ18 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Efr3bQ6ZQ18 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Efr3bQ6ZQ18 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Efr3bQ6ZQ18 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Efr3bQ6ZQ18 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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Efr3bQ6ZQ18 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
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Efr3bQ6ZQ18 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Efr3bQ6ZQ18 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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Efr3bQ6ZQ18 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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Efr3bQ6ZQ18 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Efr3bQ6ZQ18 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Efr3bQ6ZQ18 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Efr3bQ6ZQ18 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Efr3bQ6ZQ18 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Efr3bQ6ZQ18 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Efr3bQ6ZQ18 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Efr3bQ6ZQ18 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Efr3bQ6ZQ18 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Efr3bQ6ZQ18 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Efr3bQ6ZQ18 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Efr3bQ6ZQ18 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Efr3bQ6ZQ18 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Efr3bQ6ZQ18 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Efr3bQ6ZQ18 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Efr3bQ6ZQ18 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Efr3bQ6ZQ18 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Efr3bQ6ZQ18 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Efr3bQ6ZQ18 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Efr3bQ6ZQ18 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Efr3bQ6ZQ18 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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