Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPI3

Lcor, Ligand-dependent corepressor, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorQ6ZPI3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LcorQ6ZPI3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms