Protein–RNA interactions for Protein: Q6UJY2

Slc9c1, Sodium/hydrogen exchanger 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9c1Q6UJY2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc9c1Q6UJY2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc9c1Q6UJY2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc9c1Q6UJY2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc9c1Q6UJY2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc9c1Q6UJY2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc9c1Q6UJY2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc9c1Q6UJY2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc9c1Q6UJY2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc9c1Q6UJY2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc9c1Q6UJY2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc9c1Q6UJY2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc9c1Q6UJY2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc9c1Q6UJY2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc9c1Q6UJY2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc9c1Q6UJY2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc9c1Q6UJY2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc9c1Q6UJY2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc9c1Q6UJY2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc9c1Q6UJY2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc9c1Q6UJY2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc9c1Q6UJY2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc9c1Q6UJY2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc9c1Q6UJY2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc9c1Q6UJY2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc9c1Q6UJY2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc9c1Q6UJY2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc9c1Q6UJY2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc9c1Q6UJY2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc9c1Q6UJY2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc9c1Q6UJY2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc9c1Q6UJY2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc9c1Q6UJY2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc9c1Q6UJY2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc9c1Q6UJY2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc9c1Q6UJY2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc9c1Q6UJY2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc9c1Q6UJY2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc9c1Q6UJY2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc9c1Q6UJY2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc9c1Q6UJY2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc9c1Q6UJY2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc9c1Q6UJY2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc9c1Q6UJY2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc9c1Q6UJY2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc9c1Q6UJY2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc9c1Q6UJY2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc9c1Q6UJY2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc9c1Q6UJY2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc9c1Q6UJY2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc9c1Q6UJY2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc9c1Q6UJY2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc9c1Q6UJY2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc9c1Q6UJY2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc9c1Q6UJY2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc9c1Q6UJY2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc9c1Q6UJY2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc9c1Q6UJY2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc9c1Q6UJY2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc9c1Q6UJY2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc9c1Q6UJY2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc9c1Q6UJY2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc9c1Q6UJY2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc9c1Q6UJY2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc9c1Q6UJY2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc9c1Q6UJY2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc9c1Q6UJY2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc9c1Q6UJY2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc9c1Q6UJY2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc9c1Q6UJY2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc9c1Q6UJY2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc9c1Q6UJY2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc9c1Q6UJY2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc9c1Q6UJY2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc9c1Q6UJY2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc9c1Q6UJY2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc9c1Q6UJY2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc9c1Q6UJY2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc9c1Q6UJY2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc9c1Q6UJY2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc9c1Q6UJY2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc9c1Q6UJY2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc9c1Q6UJY2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc9c1Q6UJY2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc9c1Q6UJY2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc9c1Q6UJY2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc9c1Q6UJY2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc9c1Q6UJY2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc9c1Q6UJY2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc9c1Q6UJY2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc9c1Q6UJY2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc9c1Q6UJY2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc9c1Q6UJY2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc9c1Q6UJY2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc9c1Q6UJY2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc9c1Q6UJY2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc9c1Q6UJY2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc9c1Q6UJY2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc9c1Q6UJY2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc9c1Q6UJY2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms