Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ7

Cd300lf, CMRF35-like molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lfQ6SJQ7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd300lfQ6SJQ7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cd300lfQ6SJQ7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cd300lfQ6SJQ7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cd300lfQ6SJQ7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd300lfQ6SJQ7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cd300lfQ6SJQ7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd300lfQ6SJQ7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd300lfQ6SJQ7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cd300lfQ6SJQ7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd300lfQ6SJQ7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cd300lfQ6SJQ7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd300lfQ6SJQ7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cd300lfQ6SJQ7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd300lfQ6SJQ7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cd300lfQ6SJQ7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd300lfQ6SJQ7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cd300lfQ6SJQ7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd300lfQ6SJQ7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd300lfQ6SJQ7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd300lfQ6SJQ7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd300lfQ6SJQ7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd300lfQ6SJQ7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd300lfQ6SJQ7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cd300lfQ6SJQ7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cd300lfQ6SJQ7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd300lfQ6SJQ7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Cd300lfQ6SJQ7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd300lfQ6SJQ7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cd300lfQ6SJQ7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd300lfQ6SJQ7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cd300lfQ6SJQ7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd300lfQ6SJQ7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd300lfQ6SJQ7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cd300lfQ6SJQ7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd300lfQ6SJQ7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cd300lfQ6SJQ7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd300lfQ6SJQ7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd300lfQ6SJQ7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd300lfQ6SJQ7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cd300lfQ6SJQ7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cd300lfQ6SJQ7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cd300lfQ6SJQ7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cd300lfQ6SJQ7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd300lfQ6SJQ7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd300lfQ6SJQ7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd300lfQ6SJQ7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd300lfQ6SJQ7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd300lfQ6SJQ7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd300lfQ6SJQ7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd300lfQ6SJQ7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd300lfQ6SJQ7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd300lfQ6SJQ7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd300lfQ6SJQ7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd300lfQ6SJQ7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd300lfQ6SJQ7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd300lfQ6SJQ7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd300lfQ6SJQ7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd300lfQ6SJQ7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd300lfQ6SJQ7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd300lfQ6SJQ7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd300lfQ6SJQ7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd300lfQ6SJQ7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd300lfQ6SJQ7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd300lfQ6SJQ7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd300lfQ6SJQ7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd300lfQ6SJQ7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd300lfQ6SJQ7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd300lfQ6SJQ7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd300lfQ6SJQ7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd300lfQ6SJQ7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd300lfQ6SJQ7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd300lfQ6SJQ7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd300lfQ6SJQ7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd300lfQ6SJQ7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd300lfQ6SJQ7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd300lfQ6SJQ7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd300lfQ6SJQ7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd300lfQ6SJQ7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd300lfQ6SJQ7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd300lfQ6SJQ7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd300lfQ6SJQ7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd300lfQ6SJQ7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd300lfQ6SJQ7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd300lfQ6SJQ7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd300lfQ6SJQ7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd300lfQ6SJQ7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd300lfQ6SJQ7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd300lfQ6SJQ7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd300lfQ6SJQ7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd300lfQ6SJQ7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd300lfQ6SJQ7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd300lfQ6SJQ7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd300lfQ6SJQ7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd300lfQ6SJQ7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd300lfQ6SJQ7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd300lfQ6SJQ7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd300lfQ6SJQ7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd300lfQ6SJQ7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd300lfQ6SJQ7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms