Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt9Q6RHW0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt9Q6RHW0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt9Q6RHW0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt9Q6RHW0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt9Q6RHW0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt9Q6RHW0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt9Q6RHW0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt9Q6RHW0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt9Q6RHW0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt9Q6RHW0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt9Q6RHW0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt9Q6RHW0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt9Q6RHW0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt9Q6RHW0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt9Q6RHW0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt9Q6RHW0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt9Q6RHW0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt9Q6RHW0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt9Q6RHW0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt9Q6RHW0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt9Q6RHW0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt9Q6RHW0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt9Q6RHW0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt9Q6RHW0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt9Q6RHW0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt9Q6RHW0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt9Q6RHW0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt9Q6RHW0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt9Q6RHW0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt9Q6RHW0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt9Q6RHW0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt9Q6RHW0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt9Q6RHW0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt9Q6RHW0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt9Q6RHW0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt9Q6RHW0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt9Q6RHW0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt9Q6RHW0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt9Q6RHW0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt9Q6RHW0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt9Q6RHW0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt9Q6RHW0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt9Q6RHW0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt9Q6RHW0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt9Q6RHW0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt9Q6RHW0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt9Q6RHW0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt9Q6RHW0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt9Q6RHW0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt9Q6RHW0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt9Q6RHW0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt9Q6RHW0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt9Q6RHW0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt9Q6RHW0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt9Q6RHW0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt9Q6RHW0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt9Q6RHW0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt9Q6RHW0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt9Q6RHW0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt9Q6RHW0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Krt9Q6RHW0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Krt9Q6RHW0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt9Q6RHW0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt9Q6RHW0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt9Q6RHW0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt9Q6RHW0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt9Q6RHW0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt9Q6RHW0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt9Q6RHW0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt9Q6RHW0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt9Q6RHW0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt9Q6RHW0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt9Q6RHW0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt9Q6RHW0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt9Q6RHW0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt9Q6RHW0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt9Q6RHW0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt9Q6RHW0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt9Q6RHW0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt9Q6RHW0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt9Q6RHW0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt9Q6RHW0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt9Q6RHW0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt9Q6RHW0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt9Q6RHW0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt9Q6RHW0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt9Q6RHW0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt9Q6RHW0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt9Q6RHW0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt9Q6RHW0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt9Q6RHW0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt9Q6RHW0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt9Q6RHW0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt9Q6RHW0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt9Q6RHW0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt9Q6RHW0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt9Q6RHW0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt9Q6RHW0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt9Q6RHW0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms