Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIC6

Atp1a3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a3Q6PIC6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp1a3Q6PIC6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp1a3Q6PIC6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp1a3Q6PIC6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp1a3Q6PIC6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp1a3Q6PIC6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp1a3Q6PIC6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp1a3Q6PIC6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp1a3Q6PIC6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp1a3Q6PIC6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp1a3Q6PIC6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp1a3Q6PIC6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp1a3Q6PIC6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp1a3Q6PIC6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp1a3Q6PIC6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp1a3Q6PIC6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp1a3Q6PIC6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp1a3Q6PIC6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp1a3Q6PIC6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp1a3Q6PIC6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp1a3Q6PIC6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp1a3Q6PIC6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp1a3Q6PIC6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp1a3Q6PIC6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp1a3Q6PIC6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp1a3Q6PIC6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp1a3Q6PIC6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp1a3Q6PIC6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp1a3Q6PIC6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp1a3Q6PIC6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp1a3Q6PIC6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp1a3Q6PIC6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp1a3Q6PIC6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp1a3Q6PIC6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp1a3Q6PIC6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp1a3Q6PIC6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp1a3Q6PIC6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp1a3Q6PIC6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp1a3Q6PIC6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp1a3Q6PIC6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp1a3Q6PIC6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp1a3Q6PIC6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp1a3Q6PIC6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp1a3Q6PIC6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp1a3Q6PIC6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp1a3Q6PIC6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp1a3Q6PIC6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp1a3Q6PIC6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp1a3Q6PIC6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp1a3Q6PIC6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp1a3Q6PIC6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp1a3Q6PIC6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp1a3Q6PIC6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp1a3Q6PIC6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp1a3Q6PIC6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp1a3Q6PIC6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp1a3Q6PIC6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp1a3Q6PIC6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp1a3Q6PIC6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp1a3Q6PIC6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp1a3Q6PIC6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp1a3Q6PIC6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp1a3Q6PIC6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp1a3Q6PIC6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp1a3Q6PIC6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp1a3Q6PIC6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atp1a3Q6PIC6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atp1a3Q6PIC6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp1a3Q6PIC6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp1a3Q6PIC6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp1a3Q6PIC6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp1a3Q6PIC6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp1a3Q6PIC6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp1a3Q6PIC6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp1a3Q6PIC6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp1a3Q6PIC6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp1a3Q6PIC6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp1a3Q6PIC6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp1a3Q6PIC6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp1a3Q6PIC6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp1a3Q6PIC6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp1a3Q6PIC6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp1a3Q6PIC6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp1a3Q6PIC6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp1a3Q6PIC6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp1a3Q6PIC6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp1a3Q6PIC6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp1a3Q6PIC6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp1a3Q6PIC6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp1a3Q6PIC6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp1a3Q6PIC6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp1a3Q6PIC6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp1a3Q6PIC6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp1a3Q6PIC6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp1a3Q6PIC6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp1a3Q6PIC6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp1a3Q6PIC6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp1a3Q6PIC6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp1a3Q6PIC6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp1a3Q6PIC6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms