Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHZ8

Kcnip4, Kv channel-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip4Q6PHZ8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms