Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM4

Ccdc36, Interactor of HORMAD1 protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc36Q6PDM4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc36Q6PDM4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms