Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC0

Rundc3b, RUN domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3bQ6PDC0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rundc3bQ6PDC0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rundc3bQ6PDC0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rundc3bQ6PDC0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rundc3bQ6PDC0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rundc3bQ6PDC0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rundc3bQ6PDC0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rundc3bQ6PDC0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rundc3bQ6PDC0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rundc3bQ6PDC0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rundc3bQ6PDC0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rundc3bQ6PDC0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rundc3bQ6PDC0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rundc3bQ6PDC0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rundc3bQ6PDC0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rundc3bQ6PDC0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rundc3bQ6PDC0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rundc3bQ6PDC0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rundc3bQ6PDC0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rundc3bQ6PDC0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rundc3bQ6PDC0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rundc3bQ6PDC0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rundc3bQ6PDC0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rundc3bQ6PDC0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rundc3bQ6PDC0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rundc3bQ6PDC0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rundc3bQ6PDC0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rundc3bQ6PDC0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rundc3bQ6PDC0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rundc3bQ6PDC0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rundc3bQ6PDC0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rundc3bQ6PDC0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rundc3bQ6PDC0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rundc3bQ6PDC0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rundc3bQ6PDC0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rundc3bQ6PDC0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rundc3bQ6PDC0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rundc3bQ6PDC0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rundc3bQ6PDC0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rundc3bQ6PDC0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rundc3bQ6PDC0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rundc3bQ6PDC0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rundc3bQ6PDC0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rundc3bQ6PDC0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rundc3bQ6PDC0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rundc3bQ6PDC0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rundc3bQ6PDC0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rundc3bQ6PDC0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rundc3bQ6PDC0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rundc3bQ6PDC0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rundc3bQ6PDC0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rundc3bQ6PDC0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rundc3bQ6PDC0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rundc3bQ6PDC0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rundc3bQ6PDC0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rundc3bQ6PDC0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rundc3bQ6PDC0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rundc3bQ6PDC0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rundc3bQ6PDC0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rundc3bQ6PDC0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rundc3bQ6PDC0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rundc3bQ6PDC0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rundc3bQ6PDC0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rundc3bQ6PDC0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rundc3bQ6PDC0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rundc3bQ6PDC0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rundc3bQ6PDC0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rundc3bQ6PDC0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rundc3bQ6PDC0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rundc3bQ6PDC0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rundc3bQ6PDC0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rundc3bQ6PDC0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rundc3bQ6PDC0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rundc3bQ6PDC0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rundc3bQ6PDC0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rundc3bQ6PDC0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rundc3bQ6PDC0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rundc3bQ6PDC0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rundc3bQ6PDC0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rundc3bQ6PDC0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rundc3bQ6PDC0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rundc3bQ6PDC0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rundc3bQ6PDC0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rundc3bQ6PDC0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rundc3bQ6PDC0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rundc3bQ6PDC0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rundc3bQ6PDC0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rundc3bQ6PDC0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rundc3bQ6PDC0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rundc3bQ6PDC0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rundc3bQ6PDC0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rundc3bQ6PDC0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rundc3bQ6PDC0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rundc3bQ6PDC0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rundc3bQ6PDC0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rundc3bQ6PDC0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rundc3bQ6PDC0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rundc3bQ6PDC0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rundc3bQ6PDC0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rundc3bQ6PDC0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms