Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAM0

Prkab2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab2Q6PAM0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prkab2Q6PAM0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prkab2Q6PAM0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prkab2Q6PAM0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prkab2Q6PAM0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prkab2Q6PAM0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prkab2Q6PAM0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prkab2Q6PAM0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Prkab2Q6PAM0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prkab2Q6PAM0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prkab2Q6PAM0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prkab2Q6PAM0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prkab2Q6PAM0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prkab2Q6PAM0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Prkab2Q6PAM0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Prkab2Q6PAM0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Prkab2Q6PAM0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prkab2Q6PAM0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Prkab2Q6PAM0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Prkab2Q6PAM0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Prkab2Q6PAM0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Prkab2Q6PAM0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prkab2Q6PAM0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prkab2Q6PAM0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prkab2Q6PAM0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prkab2Q6PAM0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Prkab2Q6PAM0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prkab2Q6PAM0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Prkab2Q6PAM0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prkab2Q6PAM0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prkab2Q6PAM0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prkab2Q6PAM0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prkab2Q6PAM0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prkab2Q6PAM0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prkab2Q6PAM0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prkab2Q6PAM0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prkab2Q6PAM0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prkab2Q6PAM0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prkab2Q6PAM0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Prkab2Q6PAM0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prkab2Q6PAM0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prkab2Q6PAM0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prkab2Q6PAM0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prkab2Q6PAM0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prkab2Q6PAM0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prkab2Q6PAM0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prkab2Q6PAM0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prkab2Q6PAM0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prkab2Q6PAM0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prkab2Q6PAM0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prkab2Q6PAM0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prkab2Q6PAM0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prkab2Q6PAM0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Prkab2Q6PAM0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prkab2Q6PAM0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prkab2Q6PAM0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prkab2Q6PAM0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prkab2Q6PAM0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prkab2Q6PAM0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prkab2Q6PAM0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prkab2Q6PAM0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prkab2Q6PAM0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prkab2Q6PAM0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prkab2Q6PAM0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prkab2Q6PAM0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prkab2Q6PAM0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Prkab2Q6PAM0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prkab2Q6PAM0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prkab2Q6PAM0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prkab2Q6PAM0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prkab2Q6PAM0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prkab2Q6PAM0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prkab2Q6PAM0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Prkab2Q6PAM0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prkab2Q6PAM0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prkab2Q6PAM0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prkab2Q6PAM0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prkab2Q6PAM0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prkab2Q6PAM0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prkab2Q6PAM0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prkab2Q6PAM0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prkab2Q6PAM0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prkab2Q6PAM0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prkab2Q6PAM0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prkab2Q6PAM0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prkab2Q6PAM0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prkab2Q6PAM0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prkab2Q6PAM0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prkab2Q6PAM0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prkab2Q6PAM0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Prkab2Q6PAM0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prkab2Q6PAM0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prkab2Q6PAM0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Prkab2Q6PAM0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prkab2Q6PAM0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prkab2Q6PAM0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prkab2Q6PAM0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prkab2Q6PAM0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prkab2Q6PAM0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prkab2Q6PAM0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms