Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9S0

Mtss1l, MTSS1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtss1lQ6P9S0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mtss1lQ6P9S0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mtss1lQ6P9S0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mtss1lQ6P9S0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mtss1lQ6P9S0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Mtss1lQ6P9S0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mtss1lQ6P9S0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mtss1lQ6P9S0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mtss1lQ6P9S0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mtss1lQ6P9S0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mtss1lQ6P9S0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mtss1lQ6P9S0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Mtss1lQ6P9S0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mtss1lQ6P9S0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mtss1lQ6P9S0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Mtss1lQ6P9S0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mtss1lQ6P9S0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mtss1lQ6P9S0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mtss1lQ6P9S0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mtss1lQ6P9S0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mtss1lQ6P9S0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mtss1lQ6P9S0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mtss1lQ6P9S0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mtss1lQ6P9S0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mtss1lQ6P9S0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mtss1lQ6P9S0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mtss1lQ6P9S0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mtss1lQ6P9S0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mtss1lQ6P9S0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mtss1lQ6P9S0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mtss1lQ6P9S0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mtss1lQ6P9S0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mtss1lQ6P9S0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mtss1lQ6P9S0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mtss1lQ6P9S0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mtss1lQ6P9S0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mtss1lQ6P9S0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mtss1lQ6P9S0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mtss1lQ6P9S0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mtss1lQ6P9S0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mtss1lQ6P9S0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mtss1lQ6P9S0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mtss1lQ6P9S0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Mtss1lQ6P9S0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mtss1lQ6P9S0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mtss1lQ6P9S0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mtss1lQ6P9S0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mtss1lQ6P9S0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mtss1lQ6P9S0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Mtss1lQ6P9S0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mtss1lQ6P9S0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mtss1lQ6P9S0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mtss1lQ6P9S0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Mtss1lQ6P9S0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mtss1lQ6P9S0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mtss1lQ6P9S0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mtss1lQ6P9S0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mtss1lQ6P9S0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mtss1lQ6P9S0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mtss1lQ6P9S0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mtss1lQ6P9S0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mtss1lQ6P9S0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mtss1lQ6P9S0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mtss1lQ6P9S0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mtss1lQ6P9S0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mtss1lQ6P9S0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mtss1lQ6P9S0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mtss1lQ6P9S0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mtss1lQ6P9S0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mtss1lQ6P9S0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mtss1lQ6P9S0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mtss1lQ6P9S0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mtss1lQ6P9S0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mtss1lQ6P9S0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mtss1lQ6P9S0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mtss1lQ6P9S0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mtss1lQ6P9S0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mtss1lQ6P9S0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mtss1lQ6P9S0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mtss1lQ6P9S0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mtss1lQ6P9S0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mtss1lQ6P9S0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mtss1lQ6P9S0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mtss1lQ6P9S0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Mtss1lQ6P9S0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mtss1lQ6P9S0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mtss1lQ6P9S0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mtss1lQ6P9S0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mtss1lQ6P9S0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mtss1lQ6P9S0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mtss1lQ6P9S0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mtss1lQ6P9S0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mtss1lQ6P9S0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mtss1lQ6P9S0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mtss1lQ6P9S0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mtss1lQ6P9S0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mtss1lQ6P9S0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mtss1lQ6P9S0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mtss1lQ6P9S0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mtss1lQ6P9S0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms