Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rrp12Q6P5B0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rrp12Q6P5B0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rrp12Q6P5B0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rrp12Q6P5B0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rrp12Q6P5B0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rrp12Q6P5B0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rrp12Q6P5B0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rrp12Q6P5B0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rrp12Q6P5B0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rrp12Q6P5B0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rrp12Q6P5B0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rrp12Q6P5B0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rrp12Q6P5B0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rrp12Q6P5B0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rrp12Q6P5B0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rrp12Q6P5B0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rrp12Q6P5B0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rrp12Q6P5B0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rrp12Q6P5B0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rrp12Q6P5B0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rrp12Q6P5B0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rrp12Q6P5B0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rrp12Q6P5B0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rrp12Q6P5B0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rrp12Q6P5B0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rrp12Q6P5B0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rrp12Q6P5B0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rrp12Q6P5B0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rrp12Q6P5B0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rrp12Q6P5B0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rrp12Q6P5B0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rrp12Q6P5B0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rrp12Q6P5B0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rrp12Q6P5B0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rrp12Q6P5B0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms