Protein–RNA interactions for Protein: Q6P542

Abcf1, ATP-binding cassette sub-family F member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf1Q6P542 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Abcf1Q6P542 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Abcf1Q6P542 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcf1Q6P542 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcf1Q6P542 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcf1Q6P542 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcf1Q6P542 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcf1Q6P542 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcf1Q6P542 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcf1Q6P542 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcf1Q6P542 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcf1Q6P542 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcf1Q6P542 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcf1Q6P542 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcf1Q6P542 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcf1Q6P542 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcf1Q6P542 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcf1Q6P542 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcf1Q6P542 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcf1Q6P542 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcf1Q6P542 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcf1Q6P542 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcf1Q6P542 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcf1Q6P542 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcf1Q6P542 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcf1Q6P542 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcf1Q6P542 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcf1Q6P542 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcf1Q6P542 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcf1Q6P542 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcf1Q6P542 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcf1Q6P542 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcf1Q6P542 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcf1Q6P542 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcf1Q6P542 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms