Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atg2aQ6P4T0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Atg2aQ6P4T0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atg2aQ6P4T0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atg2aQ6P4T0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atg2aQ6P4T0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atg2aQ6P4T0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atg2aQ6P4T0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atg2aQ6P4T0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atg2aQ6P4T0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atg2aQ6P4T0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atg2aQ6P4T0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atg2aQ6P4T0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atg2aQ6P4T0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg2aQ6P4T0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg2aQ6P4T0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg2aQ6P4T0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg2aQ6P4T0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg2aQ6P4T0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg2aQ6P4T0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg2aQ6P4T0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg2aQ6P4T0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg2aQ6P4T0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg2aQ6P4T0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg2aQ6P4T0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg2aQ6P4T0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg2aQ6P4T0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg2aQ6P4T0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg2aQ6P4T0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg2aQ6P4T0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atg2aQ6P4T0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atg2aQ6P4T0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atg2aQ6P4T0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atg2aQ6P4T0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atg2aQ6P4T0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atg2aQ6P4T0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Atg2aQ6P4T0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Atg2aQ6P4T0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Atg2aQ6P4T0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atg2aQ6P4T0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Atg2aQ6P4T0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Atg2aQ6P4T0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atg2aQ6P4T0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atg2aQ6P4T0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atg2aQ6P4T0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atg2aQ6P4T0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atg2aQ6P4T0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Atg2aQ6P4T0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Atg2aQ6P4T0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Atg2aQ6P4T0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atg2aQ6P4T0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atg2aQ6P4T0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atg2aQ6P4T0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atg2aQ6P4T0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atg2aQ6P4T0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atg2aQ6P4T0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atg2aQ6P4T0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atg2aQ6P4T0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atg2aQ6P4T0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atg2aQ6P4T0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atg2aQ6P4T0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg2aQ6P4T0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg2aQ6P4T0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg2aQ6P4T0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg2aQ6P4T0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg2aQ6P4T0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg2aQ6P4T0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg2aQ6P4T0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg2aQ6P4T0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg2aQ6P4T0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg2aQ6P4T0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg2aQ6P4T0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg2aQ6P4T0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg2aQ6P4T0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg2aQ6P4T0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg2aQ6P4T0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg2aQ6P4T0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atg2aQ6P4T0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atg2aQ6P4T0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atg2aQ6P4T0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atg2aQ6P4T0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atg2aQ6P4T0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atg2aQ6P4T0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg2aQ6P4T0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg2aQ6P4T0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg2aQ6P4T0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg2aQ6P4T0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg2aQ6P4T0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg2aQ6P4T0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg2aQ6P4T0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg2aQ6P4T0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg2aQ6P4T0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg2aQ6P4T0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Atg2aQ6P4T0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atg2aQ6P4T0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atg2aQ6P4T0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atg2aQ6P4T0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atg2aQ6P4T0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atg2aQ6P4T0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg2aQ6P4T0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms