Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ0

Ccdc189, Coiled-coil domain-containing protein 189, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc189Q6NZQ0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc189Q6NZQ0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc189Q6NZQ0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc189Q6NZQ0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc189Q6NZQ0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc189Q6NZQ0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc189Q6NZQ0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc189Q6NZQ0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc189Q6NZQ0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc189Q6NZQ0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc189Q6NZQ0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc189Q6NZQ0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc189Q6NZQ0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc189Q6NZQ0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc189Q6NZQ0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc189Q6NZQ0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc189Q6NZQ0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc189Q6NZQ0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc189Q6NZQ0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc189Q6NZQ0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc189Q6NZQ0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc189Q6NZQ0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc189Q6NZQ0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc189Q6NZQ0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc189Q6NZQ0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc189Q6NZQ0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc189Q6NZQ0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc189Q6NZQ0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc189Q6NZQ0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc189Q6NZQ0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc189Q6NZQ0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc189Q6NZQ0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc189Q6NZQ0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc189Q6NZQ0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc189Q6NZQ0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc189Q6NZQ0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc189Q6NZQ0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc189Q6NZQ0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc189Q6NZQ0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc189Q6NZQ0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc189Q6NZQ0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc189Q6NZQ0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc189Q6NZQ0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc189Q6NZQ0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc189Q6NZQ0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc189Q6NZQ0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc189Q6NZQ0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc189Q6NZQ0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc189Q6NZQ0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc189Q6NZQ0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc189Q6NZQ0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc189Q6NZQ0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc189Q6NZQ0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc189Q6NZQ0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc189Q6NZQ0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc189Q6NZQ0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc189Q6NZQ0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc189Q6NZQ0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc189Q6NZQ0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc189Q6NZQ0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc189Q6NZQ0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc189Q6NZQ0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc189Q6NZQ0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc189Q6NZQ0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc189Q6NZQ0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc189Q6NZQ0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc189Q6NZQ0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc189Q6NZQ0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc189Q6NZQ0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc189Q6NZQ0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc189Q6NZQ0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc189Q6NZQ0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc189Q6NZQ0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc189Q6NZQ0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc189Q6NZQ0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc189Q6NZQ0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc189Q6NZQ0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc189Q6NZQ0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc189Q6NZQ0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc189Q6NZQ0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc189Q6NZQ0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc189Q6NZQ0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc189Q6NZQ0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc189Q6NZQ0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc189Q6NZQ0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc189Q6NZQ0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc189Q6NZQ0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc189Q6NZQ0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc189Q6NZQ0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc189Q6NZQ0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc189Q6NZQ0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc189Q6NZQ0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc189Q6NZQ0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc189Q6NZQ0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc189Q6NZQ0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc189Q6NZQ0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc189Q6NZQ0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc189Q6NZQ0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc189Q6NZQ0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc189Q6NZQ0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms