Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVG7

Colgalt2, Procollagen galactosyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colgalt2Q6NVG7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Colgalt2Q6NVG7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Colgalt2Q6NVG7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Colgalt2Q6NVG7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Colgalt2Q6NVG7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Colgalt2Q6NVG7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Colgalt2Q6NVG7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Colgalt2Q6NVG7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Colgalt2Q6NVG7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Colgalt2Q6NVG7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Colgalt2Q6NVG7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Colgalt2Q6NVG7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Colgalt2Q6NVG7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Colgalt2Q6NVG7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Colgalt2Q6NVG7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Colgalt2Q6NVG7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Colgalt2Q6NVG7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Colgalt2Q6NVG7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Colgalt2Q6NVG7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Colgalt2Q6NVG7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Colgalt2Q6NVG7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Colgalt2Q6NVG7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Colgalt2Q6NVG7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Colgalt2Q6NVG7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Colgalt2Q6NVG7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Colgalt2Q6NVG7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Colgalt2Q6NVG7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Colgalt2Q6NVG7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Colgalt2Q6NVG7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Colgalt2Q6NVG7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Colgalt2Q6NVG7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Colgalt2Q6NVG7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Colgalt2Q6NVG7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Colgalt2Q6NVG7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Colgalt2Q6NVG7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Colgalt2Q6NVG7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Colgalt2Q6NVG7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Colgalt2Q6NVG7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Colgalt2Q6NVG7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Colgalt2Q6NVG7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Colgalt2Q6NVG7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Colgalt2Q6NVG7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Colgalt2Q6NVG7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Colgalt2Q6NVG7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Colgalt2Q6NVG7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Colgalt2Q6NVG7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Colgalt2Q6NVG7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Colgalt2Q6NVG7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Colgalt2Q6NVG7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Colgalt2Q6NVG7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Colgalt2Q6NVG7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Colgalt2Q6NVG7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Colgalt2Q6NVG7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Colgalt2Q6NVG7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Colgalt2Q6NVG7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Colgalt2Q6NVG7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Colgalt2Q6NVG7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Colgalt2Q6NVG7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
Colgalt2Q6NVG7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Colgalt2Q6NVG7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Colgalt2Q6NVG7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Colgalt2Q6NVG7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Colgalt2Q6NVG7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Colgalt2Q6NVG7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Colgalt2Q6NVG7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Colgalt2Q6NVG7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Colgalt2Q6NVG7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Colgalt2Q6NVG7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Colgalt2Q6NVG7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Colgalt2Q6NVG7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Colgalt2Q6NVG7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Colgalt2Q6NVG7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Colgalt2Q6NVG7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Colgalt2Q6NVG7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Colgalt2Q6NVG7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Colgalt2Q6NVG7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Colgalt2Q6NVG7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Colgalt2Q6NVG7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Colgalt2Q6NVG7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Colgalt2Q6NVG7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Colgalt2Q6NVG7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Colgalt2Q6NVG7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Colgalt2Q6NVG7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Colgalt2Q6NVG7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Colgalt2Q6NVG7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Colgalt2Q6NVG7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Colgalt2Q6NVG7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Colgalt2Q6NVG7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Colgalt2Q6NVG7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Colgalt2Q6NVG7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Colgalt2Q6NVG7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Colgalt2Q6NVG7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Colgalt2Q6NVG7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Colgalt2Q6NVG7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Colgalt2Q6NVG7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Colgalt2Q6NVG7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Colgalt2Q6NVG7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Colgalt2Q6NVG7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Colgalt2Q6NVG7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Colgalt2Q6NVG7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms