Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc66Q6NS45 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc66Q6NS45 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc66Q6NS45 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc66Q6NS45 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc66Q6NS45 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc66Q6NS45 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc66Q6NS45 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc66Q6NS45 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc66Q6NS45 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc66Q6NS45 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc66Q6NS45 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc66Q6NS45 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc66Q6NS45 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc66Q6NS45 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc66Q6NS45 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc66Q6NS45 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc66Q6NS45 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc66Q6NS45 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc66Q6NS45 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc66Q6NS45 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc66Q6NS45 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc66Q6NS45 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc66Q6NS45 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc66Q6NS45 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc66Q6NS45 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc66Q6NS45 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc66Q6NS45 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc66Q6NS45 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc66Q6NS45 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc66Q6NS45 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc66Q6NS45 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc66Q6NS45 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc66Q6NS45 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc66Q6NS45 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc66Q6NS45 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc66Q6NS45 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc66Q6NS45 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc66Q6NS45 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc66Q6NS45 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc66Q6NS45 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc66Q6NS45 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc66Q6NS45 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc66Q6NS45 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc66Q6NS45 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc66Q6NS45 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc66Q6NS45 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc66Q6NS45 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc66Q6NS45 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc66Q6NS45 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc66Q6NS45 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc66Q6NS45 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc66Q6NS45 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc66Q6NS45 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc66Q6NS45 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc66Q6NS45 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc66Q6NS45 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc66Q6NS45 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc66Q6NS45 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc66Q6NS45 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc66Q6NS45 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc66Q6NS45 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc66Q6NS45 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc66Q6NS45 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc66Q6NS45 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc66Q6NS45 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc66Q6NS45 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc66Q6NS45 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc66Q6NS45 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc66Q6NS45 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc66Q6NS45 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc66Q6NS45 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc66Q6NS45 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc66Q6NS45 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc66Q6NS45 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc66Q6NS45 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc66Q6NS45 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc66Q6NS45 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc66Q6NS45 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc66Q6NS45 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc66Q6NS45 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc66Q6NS45 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc66Q6NS45 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc66Q6NS45 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc66Q6NS45 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc66Q6NS45 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc66Q6NS45 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc66Q6NS45 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc66Q6NS45 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc66Q6NS45 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc66Q6NS45 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc66Q6NS45 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc66Q6NS45 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc66Q6NS45 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc66Q6NS45 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc66Q6NS45 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc66Q6NS45 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc66Q6NS45 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc66Q6NS45 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc66Q6NS45 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms