Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMF0

Krt87, Keratin, type II cuticular 87, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt87Q6IMF0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt87Q6IMF0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt87Q6IMF0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt87Q6IMF0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt87Q6IMF0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt87Q6IMF0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt87Q6IMF0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt87Q6IMF0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt87Q6IMF0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt87Q6IMF0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt87Q6IMF0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt87Q6IMF0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt87Q6IMF0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt87Q6IMF0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt87Q6IMF0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Krt87Q6IMF0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Krt87Q6IMF0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Krt87Q6IMF0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt87Q6IMF0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Krt87Q6IMF0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt87Q6IMF0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt87Q6IMF0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt87Q6IMF0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt87Q6IMF0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt87Q6IMF0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt87Q6IMF0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt87Q6IMF0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt87Q6IMF0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt87Q6IMF0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt87Q6IMF0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt87Q6IMF0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt87Q6IMF0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt87Q6IMF0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt87Q6IMF0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.5 ms