Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Krt40Q6IFX3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Krt40Q6IFX3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Krt40Q6IFX3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt40Q6IFX3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt40Q6IFX3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt40Q6IFX3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt40Q6IFX3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt40Q6IFX3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt40Q6IFX3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt40Q6IFX3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt40Q6IFX3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt40Q6IFX3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt40Q6IFX3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt40Q6IFX3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt40Q6IFX3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt40Q6IFX3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt40Q6IFX3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt40Q6IFX3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt40Q6IFX3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt40Q6IFX3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt40Q6IFX3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt40Q6IFX3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt40Q6IFX3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt40Q6IFX3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt40Q6IFX3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt40Q6IFX3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt40Q6IFX3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt40Q6IFX3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt40Q6IFX3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt40Q6IFX3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt40Q6IFX3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt40Q6IFX3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt40Q6IFX3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt40Q6IFX3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt40Q6IFX3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt40Q6IFX3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt40Q6IFX3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt40Q6IFX3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt40Q6IFX3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt40Q6IFX3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt40Q6IFX3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt40Q6IFX3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt40Q6IFX3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt40Q6IFX3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt40Q6IFX3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt40Q6IFX3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt40Q6IFX3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt40Q6IFX3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt40Q6IFX3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt40Q6IFX3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt40Q6IFX3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt40Q6IFX3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt40Q6IFX3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt40Q6IFX3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt40Q6IFX3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt40Q6IFX3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt40Q6IFX3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt40Q6IFX3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt40Q6IFX3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Krt40Q6IFX3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Krt40Q6IFX3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt40Q6IFX3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt40Q6IFX3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt40Q6IFX3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt40Q6IFX3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt40Q6IFX3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt40Q6IFX3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt40Q6IFX3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt40Q6IFX3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt40Q6IFX3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt40Q6IFX3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt40Q6IFX3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt40Q6IFX3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt40Q6IFX3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt40Q6IFX3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt40Q6IFX3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt40Q6IFX3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt40Q6IFX3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt40Q6IFX3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt40Q6IFX3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt40Q6IFX3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt40Q6IFX3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt40Q6IFX3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt40Q6IFX3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt40Q6IFX3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt40Q6IFX3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt40Q6IFX3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt40Q6IFX3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt40Q6IFX3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt40Q6IFX3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt40Q6IFX3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt40Q6IFX3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt40Q6IFX3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt40Q6IFX3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt40Q6IFX3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt40Q6IFX3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt40Q6IFX3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt40Q6IFX3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt40Q6IFX3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
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