Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmcc1Q69ZZ6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmcc1Q69ZZ6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmcc1Q69ZZ6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmcc1Q69ZZ6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmcc1Q69ZZ6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmcc1Q69ZZ6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmcc1Q69ZZ6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmcc1Q69ZZ6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmcc1Q69ZZ6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmcc1Q69ZZ6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmcc1Q69ZZ6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmcc1Q69ZZ6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmcc1Q69ZZ6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmcc1Q69ZZ6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmcc1Q69ZZ6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmcc1Q69ZZ6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmcc1Q69ZZ6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmcc1Q69ZZ6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmcc1Q69ZZ6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmcc1Q69ZZ6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmcc1Q69ZZ6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmcc1Q69ZZ6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmcc1Q69ZZ6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmcc1Q69ZZ6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmcc1Q69ZZ6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmcc1Q69ZZ6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmcc1Q69ZZ6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmcc1Q69ZZ6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmcc1Q69ZZ6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmcc1Q69ZZ6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmcc1Q69ZZ6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmcc1Q69ZZ6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmcc1Q69ZZ6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmcc1Q69ZZ6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmcc1Q69ZZ6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmcc1Q69ZZ6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmcc1Q69ZZ6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmcc1Q69ZZ6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmcc1Q69ZZ6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmcc1Q69ZZ6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmcc1Q69ZZ6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmcc1Q69ZZ6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmcc1Q69ZZ6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmcc1Q69ZZ6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmcc1Q69ZZ6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmcc1Q69ZZ6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmcc1Q69ZZ6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmcc1Q69ZZ6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmcc1Q69ZZ6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmcc1Q69ZZ6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmcc1Q69ZZ6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Tmcc1Q69ZZ6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmcc1Q69ZZ6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmcc1Q69ZZ6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmcc1Q69ZZ6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmcc1Q69ZZ6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmcc1Q69ZZ6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmcc1Q69ZZ6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmcc1Q69ZZ6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmcc1Q69ZZ6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmcc1Q69ZZ6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmcc1Q69ZZ6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmcc1Q69ZZ6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmcc1Q69ZZ6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmcc1Q69ZZ6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmcc1Q69ZZ6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmcc1Q69ZZ6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmcc1Q69ZZ6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmcc1Q69ZZ6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmcc1Q69ZZ6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmcc1Q69ZZ6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmcc1Q69ZZ6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmcc1Q69ZZ6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmcc1Q69ZZ6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmcc1Q69ZZ6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmcc1Q69ZZ6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmcc1Q69ZZ6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmcc1Q69ZZ6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmcc1Q69ZZ6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmcc1Q69ZZ6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmcc1Q69ZZ6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmcc1Q69ZZ6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmcc1Q69ZZ6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmcc1Q69ZZ6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmcc1Q69ZZ6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmcc1Q69ZZ6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmcc1Q69ZZ6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmcc1Q69ZZ6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmcc1Q69ZZ6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmcc1Q69ZZ6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmcc1Q69ZZ6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmcc1Q69ZZ6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmcc1Q69ZZ6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmcc1Q69ZZ6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmcc1Q69ZZ6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms